37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3744 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3744  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  320  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00547053 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4619  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  320  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364454  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3779  hypothetical protein  97.79 
 
 		 136 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00992647  decreased coverage  0.000841718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5483  hypothetical protein  86.67 
 
 		 153 aa  277  5e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.03639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2349  hypothetical protein  90.37 
 
 		 136 aa  261  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3629  hypothetical protein  90.98 
 
 		 136 aa  257  4e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4979  hypothetical protein  80.14 
 
 		 179 aa  245  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6642  hypothetical protein  66.22 
 
 		 148 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0807  hypothetical protein  66.67 
 
 		 208 aa  207  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523267  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1813  hypothetical protein  64 
 
 		 206 aa  206  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2165  hypothetical protein  70.15 
 
 		 208 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0898  hypothetical protein  70.15 
 
 		 208 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234161  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0776  hypothetical protein  39.16 
 
 		 186 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.772456  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0303  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.41 
 
 		 232 aa  103  9e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2166  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  38.1 
 
 		 954 aa  100  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.16902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4383  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.69 
 
 		 233 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.245541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1579  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.51 
 
 		 232 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.988473 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3834  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.53 
 
 		 233 aa  94  8e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0353  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.851273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0935  hypothetical protein  40.83 
 
 		 247 aa  88.6  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.638492  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2232  hypothetical protein  35.46 
 
 		 159 aa  88.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2666  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  37.25 
 
 		 224 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162936  normal  0.560234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2357  hypothetical protein  35.85 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1370  hypothetical protein  32.67 
 
 		 921 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379197 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4278  hypothetical protein  35.05 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.335635  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0689  hypothetical protein  27.59 
 
 		 1084 aa  57  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4250  hypothetical protein  31.96 
 
 		 290 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4097  hypothetical protein  31.96 
 
 		 264 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4923  putative exported protein of unknown function  30.93 
 
 		 247 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.616045  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0587  hypothetical protein  35.11 
 
 		 208 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.11001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1193  hypothetical protein  32.63 
 
 		 217 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.720566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0679  hypothetical protein  32.98 
 
 		 200 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.174044  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0791  hypothetical protein  24.83 
 
 		 251 aa  50.8  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0789  hypothetical protein  26.45 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.630269  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2148  hypothetical protein  41.38 
 
 		 309 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0448  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.983907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6578  hypothetical protein  30.53 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>