More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0458 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0458  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 1012 aa  2034    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0209  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.55 
 
 		 1260 aa  229  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0238  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.27 
 
 		 1263 aa  228  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0771  putative peptidoglycan-binding protein  40.87 
 
 		 978 aa  222  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00367817  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4037  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.79 
 
 		 1196 aa  221  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0601  hypothetical protein  38.4 
 
 		 1275 aa  201  9e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0147  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.47 
 
 		 1226 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240041 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0183  Sel1 repeat-containing protein  26.66 
 
 		 1059 aa  197  9e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0882  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.03 
 
 		 1110 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.574847  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3570  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.51 
 
 		 1110 aa  178  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.571273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3442  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.67 
 
 		 1088 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3098  Sel1 domain-containing protein  43.89 
 
 		 1242 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.445363  normal  0.0478733 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3246  Sel1 domain-containing protein  42.58 
 
 		 1145 aa  174  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00516483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0812  hypothetical protein  48.69 
 
 		 1160 aa  174  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940934  normal  0.237847 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0248  Sel1-like  48.3 
 
 		 1086 aa  174  7.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0822  peptidoglycan-binding protein, putative  36.22 
 
 		 913 aa  172  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4609  Sel1-like protein  46.02 
 
 		 1105 aa  169  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0801  Sel1  44.89 
 
 		 1134 aa  167  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.835897  normal  0.855509 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0535  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.2 
 
 		 1072 aa  166  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  47.85 
 
 		 1105 aa  166  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5289  Sel1 domain protein repeat-containing protein  43.13 
 
 		 1199 aa  163  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0371933  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1095  Sel1 domain-containing protein  40.24 
 
 		 1003 aa  150  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0265  Sel1 domain protein repeat-containing protein  41.4 
 
 		 884 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0121173 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1450  peptidoglycan binding domain-containing protein  34.95 
 
 		 997 aa  139  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0762725 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1484  Sel1 domain-containing protein  39.66 
 
 		 246 aa  134  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.743367  normal  0.990393 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  32.77 
 
 		 789 aa  132  4.0000000000000003e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2705  Sel1 repeat-containing protein  34.93 
 
 		 241 aa  129  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1767  hypothetical protein  43.33 
 
 		 1037 aa  127  8.000000000000001e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.636968 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1736  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.65 
 
 		 318 aa  127  9e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.425462  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  44 
 
 		 684 aa  125  4e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  43.23 
 
 		 961 aa  124  6e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2411  hypothetical protein  40.88 
 
 		 235 aa  124  9e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0196875  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  38.61 
 
 		 831 aa  124  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3064  Sel1 domain-containing protein  41.01 
 
 		 795 aa  124  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.50136 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  42.67 
 
 		 1402 aa  122  3.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4237  peptidoglycan-binding LysM  43.59 
 
 		 1910 aa  120  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618664  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0781  Sel1 domain-containing protein  44.08 
 
 		 393 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000364549  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1888  Sel1 domain protein repeat-containing protein  45.77 
 
 		 346 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.15133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5233  Sel1 domain-containing protein  44.31 
 
 		 416 aa  120  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1584  hypothetical protein  44.06 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0106246 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0892  hypothetical protein  40.96 
 
 		 1877 aa  117  7.999999999999999e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.413085 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  35.45 
 
 		 425 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  39.6 
 
 		 305 aa  117  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6186  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.65 
 
 		 316 aa  115  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0204  Sel1 domain-containing protein  33.95 
 
 		 344 aa  115  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  40 
 
 		 2413 aa  114  8.000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1490  TPR repeat-containing protein  36.07 
 
 		 303 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.471259999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2230  Sel1  40.13 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0660698 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.94 
 
 		 528 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  43.8 
 
 		 557 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04070  TPR repeat-containing protein  42.95 
 
 		 1032 aa  113  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.350939 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2554  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.64 
 
 		 392 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.311361  normal  0.38185 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0895  hypothetical protein  38.56 
 
 		 1493 aa  111  5e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.213201 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1174  hypothetical protein  35.47 
 
 		 490 aa  111  6e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3702  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  35.37 
 
 		 448 aa  111  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1180  hypothetical protein  36.72 
 
 		 490 aa  110  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0104  Sel1 repeat-containing protein  42.76 
 
 		 489 aa  110  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1118  hypothetical protein  37.42 
 
 		 329 aa  110  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.420783 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02823  hypothetical protein  41.22 
 
 		 256 aa  109  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2582  Sel1 domain-containing protein  42.55 
 
 		 359 aa  109  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.805298  normal  0.0195888 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3151  Sel1 domain-containing protein  44.14 
 
 		 255 aa  109  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.221921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1495  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  38.24 
 
 		 193 aa  109  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.133647  normal  0.066583 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0954  hypothetical protein  40.14 
 
 		 838 aa  108  5e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3372  Sel1 domain-containing protein  38.36 
 
 		 685 aa  108  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0437762  normal  0.412593 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2147  hypothetical protein  36.99 
 
 		 373 aa  107  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1171  hypothetical protein  37.11 
 
 		 267 aa  107  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.786913  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1612  Sel1  38.51 
 
 		 232 aa  107  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0239674 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2279  Sel1 domain-containing protein  39.86 
 
 		 464 aa  105  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.181381  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0313  TPR repeat-containing protein  41.38 
 
 		 252 aa  106  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.526725  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  34 
 
 		 358 aa  105  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1310  hypothetical protein  37.29 
 
 		 376 aa  105  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2894  hypothetical protein  37.59 
 
 		 245 aa  105  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1307  hypothetical protein  36.72 
 
 		 376 aa  103  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1864  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.69 
 
 		 278 aa  104  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00318997  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0034  Sel1 domain-containing protein  39.31 
 
 		 763 aa  103  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0277  Sel1 repeat-containing protein  37.41 
 
 		 271 aa  103  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0937  serine/threonine protein kinase  39.86 
 
 		 1430 aa  103  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0370289 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0432  hypothetical protein  37.33 
 
 		 1002 aa  103  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0267452 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2174  hypothetical protein  35.84 
 
 		 373 aa  102  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1310  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.69 
 
 		 341 aa  102  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.218187  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2652  Sel1 domain-containing protein  36.81 
 
 		 410 aa  102  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.52998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3235  AAA ATPase  40.14 
 
 		 839 aa  102  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2045  Sel1 domain protein repeat-containing protein  38.65 
 
 		 865 aa  101  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1586  Sel1 domain-containing protein  37.65 
 
 		 380 aa  101  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.139807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1450  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.36 
 
 		 380 aa  101  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1059  hypothetical protein  37.91 
 
 		 342 aa  100  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0449  Sel1 domain-containing protein  37.74 
 
 		 276 aa  100  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0312  TPR repeat-containing protein  40.94 
 
 		 223 aa  99.8  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.21253  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0463  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.34 
 
 		 255 aa  99.8  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1450  Sel1 domain-containing protein  40.37 
 
 		 274 aa  98.6  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0715034  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4028  Sel1 domain-containing protein  34.72 
 
 		 301 aa  98.2  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.530844  normal  0.391512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3725  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.45 
 
 		 248 aa  97.8  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1811  hypothetical protein  36.24 
 
 		 208 aa  97.4  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1218  hypothetical protein  31.74 
 
 		 552 aa  97.4  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0024  putative signal peptide protein  36.65 
 
 		 252 aa  97.1  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0407866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1123  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.76 
 
 		 222 aa  96.7  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  35.83 
 
 		 976 aa  97.1  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3402  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.27 
 
 		 248 aa  96.3  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2982  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.6 
 
 		 325 aa  95.9  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.805315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3001  Sel1 domain-containing protein  36.6 
 
 		 325 aa  95.9  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>