279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1953 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  100 
 
 		 234 aa  471  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  63.21 
 
 		 225 aa  251  9.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  63.68 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  52.56 
 
 		 236 aa  234  8e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  49.15 
 
 		 239 aa  234  9e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  53.88 
 
 		 247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  45.49 
 
 		 253 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  45.1 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  45.1 
 
 		 253 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  45.1 
 
 		 253 aa  216  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  45.1 
 
 		 253 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  44.71 
 
 		 253 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  44.44 
 
 		 259 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  44.44 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  44.44 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  48.12 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  50.22 
 
 		 270 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  45.8 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  54.12 
 
 		 228 aa  211  5.999999999999999e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  50.64 
 
 		 228 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  43.35 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  49.28 
 
 		 234 aa  204  8e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  44.12 
 
 		 242 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  44.74 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  49.02 
 
 		 224 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  63.78 
 
 		 185 aa  175  7e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  53.42 
 
 		 286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  46.6 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  57.69 
 
 		 261 aa  155  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  50.6 
 
 		 546 aa  153  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  61.26 
 
 		 241 aa  150  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  55.15 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  43.67 
 
 		 242 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  54.03 
 
 		 165 aa  141  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  54.7 
 
 		 197 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  59.82 
 
 		 231 aa  132  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  49.62 
 
 		 163 aa  128  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0734  cell wall hydrolase, SleB  52.21 
 
 		 239 aa  125  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  46.85 
 
 		 200 aa  119  3e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2186  cell wall hydrolase, SleB  53.57 
 
 		 190 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2662  putative spore-cortex-lytic enzyme  46.85 
 
 		 200 aa  118  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  52.5 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  46.67 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  48.33 
 
 		 239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  40.61 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  50.85 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  49.57 
 
 		 194 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  46.67 
 
 		 265 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  46.67 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  46.67 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  46.67 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  46.67 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  46.67 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  46.67 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  45.93 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  45.93 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  47.83 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  47.5 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  47.41 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  47.01 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  45.26 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1335  cell wall hydrolase, SleB  42.86 
 
 		 201 aa  99  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0172896  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0147  cell wall hydrolase  48.33 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  49.59 
 
 		 267 aa  93.2  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  36.13 
 
 		 304 aa  90.1  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2132  cell wall hydrolase SleB  36.42 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1251  cell wall hydrolase SleB  34.2 
 
 		 222 aa  85.9  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  32.17 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  39.68 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  38.26 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3512  cell wall hydrolase SleB  33.6 
 
 		 400 aa  65.1  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000979534  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  34.33 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  35.16 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  34.56 
 
 		 429 aa  63.5  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  41 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  55.93 
 
 		 321 aa  62.8  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  29.58 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  35.38 
 
 		 375 aa  62.4  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  35.56 
 
 		 404 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  33.86 
 
 		 377 aa  62  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  32.87 
 
 		 402 aa  62  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  32.52 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3002  cell wall hydrolase SleB  32.8 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000336661  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  37.5 
 
 		 429 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.69 
 
 		 77 aa  61.6  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  34.43 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  32.57 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  37.6 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  28.81 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  34.85 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  35 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  35.71 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  37.11 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  33.57 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  28.18 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.69 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4788  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.907058  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  32.17 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  34.4 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  34.71 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>