138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2308 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  100 
 
 		 214 aa  447  1e-125  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  54.46 
 
 		 230 aa  228  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  44.9 
 
 		 229 aa  176  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  44.62 
 
 		 228 aa  161  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  51.41 
 
 		 240 aa  148  5e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  51.41 
 
 		 240 aa  148  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  53.33 
 
 		 179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  48.8 
 
 		 460 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  48 
 
 		 466 aa  129  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  46.56 
 
 		 255 aa  127  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  44.03 
 
 		 476 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  44.03 
 
 		 496 aa  125  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  44.8 
 
 		 375 aa  125  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1225  cell wall hydrolase, SleB  44.36 
 
 		 474 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.31402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2593  cell wall hydrolase SleB  46.09 
 
 		 432 aa  122  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  38.27 
 
 		 429 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  41.79 
 
 		 476 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1104  cell wall hydrolase, SleB  41.04 
 
 		 472 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  43.61 
 
 		 429 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  42.86 
 
 		 409 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  44.44 
 
 		 433 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  44.53 
 
 		 383 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  43.65 
 
 		 377 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  41.35 
 
 		 402 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  45.31 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  41.79 
 
 		 391 aa  115  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  44.53 
 
 		 410 aa  114  7.999999999999999e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  45.67 
 
 		 446 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  43.65 
 
 		 301 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  43.65 
 
 		 301 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  42.86 
 
 		 404 aa  109  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  42.06 
 
 		 301 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2483  cell wall hydrolase SleB  29.9 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.539309  normal  0.112371 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  42.06 
 
 		 365 aa  104  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  34.97 
 
 		 412 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  38.76 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0607  cell wall hydrolase, SleB  41.8 
 
 		 376 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.356113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  31.07 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1044  cell wall hydrolase, SleB  40.94 
 
 		 380 aa  102  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  40 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  31.9 
 
 		 217 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  44.44 
 
 		 409 aa  100  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  31.9 
 
 		 203 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  37.7 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  35.94 
 
 		 209 aa  92  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3383  cell wall hydrolase, SleB  33.82 
 
 		 208 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  38.58 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  42.52 
 
 		 310 aa  72  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  39.37 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  39.37 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  39.68 
 
 		 234 aa  68.2  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0543  cell wall hydrolase, SleB  38.24 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  34.88 
 
 		 187 aa  68.2  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  39.72 
 
 		 546 aa  66.6  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  29.57 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  32.84 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  28.57 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  31.69 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  31.69 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  31.69 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  31.69 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  31.69 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  31.69 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  31.69 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  31.69 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  31.69 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  37.59 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  34.68 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  31.69 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  32.68 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  35.2 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  33.33 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  37.3 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  31.54 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  37.93 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  29.61 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  33.87 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  32.59 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2496  hypothetical protein  32.71 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1928  cell wall hydrolase, SleB  34.55 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.397103  normal  0.0105522 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1223  cell wall hydrolase family protein  32.59 
 
 		 284 aa  58.9  0.00000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0182396  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  37.1 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  33.87 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2662  putative spore-cortex-lytic enzyme  29.84 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  29.84 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0934  cell wall hydrolase, SleB  32.69 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0249675  normal  0.838276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  32.81 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02539  cell Wall Hydrolase superfamily  32.09 
 
 		 153 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  34.4 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4238  hypothetical protein  29.41 
 
 		 1136 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  33.33 
 
 		 265 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  33.87 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3512  cell wall hydrolase SleB  32.06 
 
 		 400 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000979534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  34.4 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  34.4 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  34.4 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1894  hypothetical protein  36.56 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  31.2 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6696  cell wall hydrolase SleB  28.93 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  32.24 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>