118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3512 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3512  cell wall hydrolase SleB  100 
 
 		 400 aa  816    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000979534  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  37.01 
 
 		 235 aa  90.9  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  39.84 
 
 		 197 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  34.39 
 
 		 208 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  32.96 
 
 		 194 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  38.52 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  32.86 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  37.8 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  36.29 
 
 		 253 aa  82  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  37.76 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  41.75 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  40.15 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  40.15 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  35.88 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  39.39 
 
 		 265 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  39.39 
 
 		 265 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  39.39 
 
 		 265 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  39.39 
 
 		 265 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  39.39 
 
 		 265 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  39.39 
 
 		 265 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  39.39 
 
 		 265 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  35.2 
 
 		 546 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  39.39 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  32 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  34.33 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0734  cell wall hydrolase, SleB  32.06 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  37.5 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  28.25 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  35.24 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  34.03 
 
 		 310 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  32.52 
 
 		 228 aa  72.8  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  31.33 
 
 		 267 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2132  cell wall hydrolase SleB  36.43 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  39.25 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2662  putative spore-cortex-lytic enzyme  37.5 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  31.97 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  33.07 
 
 		 200 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  33.6 
 
 		 224 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  32.54 
 
 		 236 aa  68.6  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2186  cell wall hydrolase, SleB  38.54 
 
 		 190 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  34.74 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  34.38 
 
 		 163 aa  67.4  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  28.65 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  32.03 
 
 		 270 aa  67  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  28.97 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1335  cell wall hydrolase, SleB  31.05 
 
 		 201 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0172896  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  41.44 
 
 		 267 aa  66.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0147  cell wall hydrolase  37.12 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  33.6 
 
 		 234 aa  65.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  29.87 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  35.04 
 
 		 231 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1251  cell wall hydrolase SleB  34.85 
 
 		 222 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  29.11 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  34.11 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  32.54 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  32.54 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  32.54 
 
 		 259 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  32.54 
 
 		 253 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  32.54 
 
 		 253 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  31.34 
 
 		 253 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  32.54 
 
 		 253 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  32.54 
 
 		 259 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  32.54 
 
 		 253 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  31.68 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  33.33 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  33.58 
 
 		 375 aa  60.1  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  30.32 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  32.79 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  33.06 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  28.8 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  30.53 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  32.06 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  34.78 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  31.3 
 
 		 179 aa  55.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  41.27 
 
 		 255 aa  54.3  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  28.68 
 
 		 429 aa  54.3  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  33.07 
 
 		 225 aa  53.9  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  28.57 
 
 		 229 aa  53.1  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  30.66 
 
 		 377 aa  53.1  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  27.94 
 
 		 429 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3383  cell wall hydrolase, SleB  32.7 
 
 		 208 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  26.53 
 
 		 228 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  28.81 
 
 		 261 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3002  cell wall hydrolase SleB  29.81 
 
 		 488 aa  51.2  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000336661  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  31.16 
 
 		 391 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  29.27 
 
 		 245 aa  50.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  28.36 
 
 		 240 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  28.36 
 
 		 240 aa  50.1  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3911  cell wall hydrolase SleB  30.19 
 
 		 140 aa  48.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  28.47 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  28.47 
 
 		 409 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  33.94 
 
 		 203 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  41.79 
 
 		 383 aa  47  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  34.62 
 
 		 217 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  34.62 
 
 		 203 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5519  cell wall hydrolase  30.39 
 
 		 140 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  29.37 
 
 		 220 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  26.92 
 
 		 466 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2483  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 		 203 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.539309  normal  0.112371 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5569  cell wall hydrolase  29.25 
 
 		 140 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>