88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_1223 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_1223  cell wall hydrolase family protein  100 
 
 
284 aa  588  1e-167  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0182396  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0765  cell wall hydrolase SleB  53.81 
 
 
315 aa  206  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.769298  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2145  putative lipoprotein  56.55 
 
 
326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2059  putative lipoprotein  56.55 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.332093  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5847  cell wall hydrolase SleB  47.37 
 
 
287 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374564  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6759  cell wall hydrolase SleB  41.57 
 
 
278 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.582595  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0543  cell wall hydrolase, SleB  69.75 
 
 
169 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6696  cell wall hydrolase SleB  52.66 
 
 
235 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  63.93 
 
 
226 aa  169  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1894  hypothetical protein  71.82 
 
 
129 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1928  cell wall hydrolase, SleB  59.26 
 
 
169 aa  163  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.397103  normal  0.0105522 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2496  hypothetical protein  63.87 
 
 
166 aa  161  9e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0934  cell wall hydrolase, SleB  57.78 
 
 
169 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0249675  normal  0.838276 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1671  cell wall hydrolase SleB  67.5 
 
 
208 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.535782  decreased coverage  0.0020174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2798  cell wall hydrolase SleB  58.06 
 
 
245 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3026  cell wall hydrolase SleB  58.06 
 
 
245 aa  153  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0983766  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2922  cell wall hydrolase SleB  47.06 
 
 
245 aa  153  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  34.09 
 
 
179 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  36.36 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  36.36 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  36.36 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  36.57 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  38.3 
 
 
221 aa  62.8  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  54 
 
 
433 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  48.21 
 
 
410 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  32.58 
 
 
209 aa  60.1  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  45.61 
 
 
409 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  38.3 
 
 
391 aa  59.7  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  45.61 
 
 
402 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0607  cell wall hydrolase, SleB  31.01 
 
 
376 aa  59.7  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.356113  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  33.08 
 
 
375 aa  59.3  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  32.59 
 
 
214 aa  58.9  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  45.71 
 
 
460 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  32 
 
 
229 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  47.06 
 
 
429 aa  57  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0796  cell wall hydrolase SleB  28.68 
 
 
152 aa  57  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.138978 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  36.29 
 
 
409 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  34.96 
 
 
255 aa  57  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  31.4 
 
 
207 aa  56.2  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  48 
 
 
301 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  45.1 
 
 
429 aa  56.2  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  46 
 
 
301 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  46 
 
 
301 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3383  cell wall hydrolase, SleB  33.33 
 
 
208 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  44.29 
 
 
466 aa  55.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  31.2 
 
 
230 aa  54.3  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  52 
 
 
187 aa  54.3  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02539  cell Wall Hydrolase superfamily  28.06 
 
 
153 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1044  cell wall hydrolase, SleB  36.63 
 
 
380 aa  53.9  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  33.68 
 
 
383 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  53.19 
 
 
496 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  34.69 
 
 
203 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  46 
 
 
446 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  50.94 
 
 
186 aa  53.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  46 
 
 
365 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  37.04 
 
 
231 aa  53.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  27.13 
 
 
189 aa  52.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  41.07 
 
 
377 aa  52.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  33.67 
 
 
203 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  33.67 
 
 
217 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1225  cell wall hydrolase, SleB  48 
 
 
474 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.31402  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1104  cell wall hydrolase, SleB  48 
 
 
472 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  46 
 
 
404 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2483  cell wall hydrolase SleB  32.65 
 
 
203 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.539309  normal  0.112371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2593  cell wall hydrolase SleB  45.65 
 
 
432 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  46 
 
 
476 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  48.98 
 
 
476 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  40 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  46.51 
 
 
412 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  35.8 
 
 
233 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  42 
 
 
197 aa  45.8  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  31.52 
 
 
546 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  34.83 
 
 
229 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  32.69 
 
 
235 aa  43.9  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  37.23 
 
 
163 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  31 
 
 
208 aa  43.5  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  30.53 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  40.38 
 
 
310 aa  43.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  42.86 
 
 
282 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  29.7 
 
 
277 aa  43.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  28.57 
 
 
242 aa  42.7  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  34.55 
 
 
253 aa  42  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  34.55 
 
 
253 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  34.55 
 
 
253 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  34.55 
 
 
253 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  34.55 
 
 
253 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  34.55 
 
 
253 aa  42  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  34.55 
 
 
259 aa  42  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>