128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2348 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  100 
 
 		 200 aa  412  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2662  putative spore-cortex-lytic enzyme  98.5 
 
 		 200 aa  406  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  46.51 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  46.85 
 
 		 234 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  45.6 
 
 		 267 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  47.01 
 
 		 259 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  43.22 
 
 		 267 aa  119  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  47.01 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  47.01 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  47.01 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  47.01 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  47.01 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  47.01 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  47.01 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  47.01 
 
 		 259 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  47.01 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  44.8 
 
 		 270 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  41.73 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  43.65 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  41.67 
 
 		 286 aa  115  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  39.46 
 
 		 224 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  41.6 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  43.44 
 
 		 239 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  40.15 
 
 		 236 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  39.5 
 
 		 310 aa  106  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  44.74 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  36.03 
 
 		 185 aa  105  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1335  cell wall hydrolase, SleB  45.38 
 
 		 201 aa  104  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0172896  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  40.17 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  42.06 
 
 		 546 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  37.7 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  41.27 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  41.59 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  39.84 
 
 		 233 aa  99.4  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  42.62 
 
 		 216 aa  98.2  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  44.35 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  38.57 
 
 		 203 aa  96.3  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  43.48 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  42.57 
 
 		 228 aa  95.9  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0734  cell wall hydrolase, SleB  38.52 
 
 		 239 aa  95.5  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  41.27 
 
 		 197 aa  95.1  6e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  40.52 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2186  cell wall hydrolase, SleB  42.24 
 
 		 190 aa  91.3  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  37.04 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  38.98 
 
 		 163 aa  90.1  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  41.44 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2132  cell wall hydrolase SleB  42.11 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  38.6 
 
 		 234 aa  89  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  37.5 
 
 		 264 aa  87.8  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  39.64 
 
 		 277 aa  86.3  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  40.94 
 
 		 265 aa  85.5  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  40.94 
 
 		 265 aa  84.7  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  35.29 
 
 		 208 aa  84.7  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  40.94 
 
 		 265 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  41.73 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  41.73 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  41.73 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  41.73 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  40.94 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  41.73 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1251  cell wall hydrolase SleB  42.11 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  40.16 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  37.39 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  30.29 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  25.33 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3512  cell wall hydrolase SleB  33.07 
 
 		 400 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000979534  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  31.58 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  31.91 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  33.79 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0147  cell wall hydrolase  38.58 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  33.02 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  35.48 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  32.23 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  35.59 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  34.75 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3002  cell wall hydrolase SleB  28.46 
 
 		 488 aa  58.5  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000336661  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  34.75 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  29.84 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  25.41 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  36.23 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2483  cell wall hydrolase SleB  29.49 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.539309  normal  0.112371 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  26.32 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  25 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  25 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  32.03 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  25.98 
 
 		 301 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  25.98 
 
 		 301 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  25.98 
 
 		 301 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0543  cell wall hydrolase, SleB  37.74 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  43.14 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  31.67 
 
 		 377 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0765  cell wall hydrolase SleB  32.32 
 
 		 315 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.769298  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  25.5 
 
 		 375 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  27.56 
 
 		 365 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  22.89 
 
 		 433 aa  50.1  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3383  cell wall hydrolase, SleB  29.56 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  28.23 
 
 		 383 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  27.78 
 
 		 255 aa  49.3  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5166  cell wall hydrolase SleB  28.57 
 
 		 250 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.847272  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>