131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0730 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  100 
 
 		 245 aa  508  1e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  51.16 
 
 		 446 aa  138  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  52.71 
 
 		 404 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  50.77 
 
 		 429 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  52.27 
 
 		 377 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  51.59 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  50.77 
 
 		 429 aa  136  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  52.76 
 
 		 410 aa  135  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  53.08 
 
 		 402 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  50.77 
 
 		 301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  50.77 
 
 		 301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  49.23 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  50.78 
 
 		 433 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  52.27 
 
 		 391 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  50 
 
 		 365 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  52.31 
 
 		 409 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  43.54 
 
 		 466 aa  130  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  39.01 
 
 		 460 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  47.1 
 
 		 412 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  50.77 
 
 		 383 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1225  cell wall hydrolase, SleB  41.5 
 
 		 474 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.31402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  40.4 
 
 		 476 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  41.78 
 
 		 476 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1104  cell wall hydrolase, SleB  43.07 
 
 		 472 aa  121  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  48.48 
 
 		 409 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  51.2 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2593  cell wall hydrolase SleB  42.75 
 
 		 432 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  42.45 
 
 		 496 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  42.96 
 
 		 375 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  46.09 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  45.31 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1044  cell wall hydrolase, SleB  42.42 
 
 		 380 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0607  cell wall hydrolase, SleB  39.01 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.356113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  45.11 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  45.11 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  44.36 
 
 		 228 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  42.31 
 
 		 209 aa  99  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  38.69 
 
 		 207 aa  99  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  41.56 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  42.22 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  38.93 
 
 		 203 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  36.64 
 
 		 217 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  36.64 
 
 		 203 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2483  cell wall hydrolase SleB  36.64 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.539309  normal  0.112371 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  45.31 
 
 		 186 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3383  cell wall hydrolase, SleB  35.04 
 
 		 208 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  45.74 
 
 		 187 aa  85.9  6e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  37.3 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  37.8 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  33.1 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  33.07 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  33.07 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  33.07 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  33.07 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  33.07 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  33.07 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  33.07 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  33.07 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  33.07 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  33.07 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  34.65 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  33.07 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1223  cell wall hydrolase family protein  36.57 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0182396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  34.31 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  32.28 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  34.92 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  31.5 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  34.62 
 
 		 546 aa  65.5  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  36 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  33.06 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2059  putative lipoprotein  39.22 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.332093  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2145  putative lipoprotein  35.82 
 
 		 326 aa  62.4  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2662  putative spore-cortex-lytic enzyme  32.23 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6696  cell wall hydrolase SleB  36.51 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  32.23 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  34.43 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  37.78 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0765  cell wall hydrolase SleB  33.58 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.769298  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5847  cell wall hydrolase SleB  30.15 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  30.34 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  28.12 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  29.93 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  30.71 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  30.4 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  31.75 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  29.93 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  29.93 
 
 		 265 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  29.5 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  29.5 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  29.5 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  29.5 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  29.5 
 
 		 265 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3026  cell wall hydrolase SleB  33.58 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0983766  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2496  hypothetical protein  33.87 
 
 		 166 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2798  cell wall hydrolase SleB  33.58 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  32.33 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  29.2 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  29.2 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  29.69 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>