75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0765 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0765  cell wall hydrolase SleB  100 
 
 
315 aa  650    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.769298  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2145  putative lipoprotein  74.16 
 
 
326 aa  454  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2059  putative lipoprotein  74.16 
 
 
326 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.332093  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5847  cell wall hydrolase SleB  54.03 
 
 
287 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374564  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6759  cell wall hydrolase SleB  51.89 
 
 
278 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.582595  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1223  cell wall hydrolase family protein  46.69 
 
 
284 aa  211  1e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0182396  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0543  cell wall hydrolase, SleB  68.38 
 
 
169 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2496  hypothetical protein  61.54 
 
 
166 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  51.32 
 
 
226 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1928  cell wall hydrolase, SleB  61.83 
 
 
169 aa  182  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.397103  normal  0.0105522 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0934  cell wall hydrolase, SleB  60.77 
 
 
169 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0249675  normal  0.838276 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6696  cell wall hydrolase SleB  49.01 
 
 
235 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1894  hypothetical protein  69.72 
 
 
129 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1671  cell wall hydrolase SleB  69.75 
 
 
208 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.535782  decreased coverage  0.0020174 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2798  cell wall hydrolase SleB  61.9 
 
 
245 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2922  cell wall hydrolase SleB  61.9 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3026  cell wall hydrolase SleB  61.9 
 
 
245 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0983766  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  38.38 
 
 
221 aa  64.3  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  30.89 
 
 
179 aa  63.5  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  36.73 
 
 
209 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  48.15 
 
 
433 aa  60.5  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  33.58 
 
 
245 aa  60.1  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1104  cell wall hydrolase, SleB  29.19 
 
 
472 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1225  cell wall hydrolase, SleB  27.13 
 
 
474 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.31402  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1044  cell wall hydrolase, SleB  29.69 
 
 
380 aa  57.4  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0607  cell wall hydrolase, SleB  27.82 
 
 
376 aa  57.4  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.356113  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  39.74 
 
 
187 aa  56.2  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  45.45 
 
 
410 aa  55.8  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  28.67 
 
 
255 aa  55.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  51.02 
 
 
460 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  27.81 
 
 
496 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  43.86 
 
 
466 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  28.76 
 
 
409 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0796  cell wall hydrolase SleB  30 
 
 
152 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.138978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  28.89 
 
 
375 aa  54.3  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  29.41 
 
 
476 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  31.37 
 
 
301 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  32.89 
 
 
186 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02539  cell Wall Hydrolase superfamily  30.71 
 
 
153 aa  53.1  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  37.31 
 
 
301 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  37.31 
 
 
301 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  44.83 
 
 
240 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  44.83 
 
 
240 aa  52.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  29.03 
 
 
207 aa  52.4  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  28.8 
 
 
230 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  45.45 
 
 
203 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  29.59 
 
 
476 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  44.23 
 
 
228 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  39.29 
 
 
402 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  32.91 
 
 
409 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2593  cell wall hydrolase SleB  44 
 
 
432 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  38.18 
 
 
429 aa  50.8  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  27.91 
 
 
365 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2662  putative spore-cortex-lytic enzyme  30.77 
 
 
200 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  32.32 
 
 
200 aa  50.4  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2483  cell wall hydrolase SleB  44.44 
 
 
203 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.539309  normal  0.112371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  43.14 
 
 
446 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  42.22 
 
 
217 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  32.04 
 
 
214 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  42.22 
 
 
203 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  29.11 
 
 
391 aa  48.5  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  43.14 
 
 
404 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  35.59 
 
 
231 aa  47.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  33.93 
 
 
377 aa  47.8  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  30.77 
 
 
189 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  34.55 
 
 
429 aa  47  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  41.18 
 
 
229 aa  46.6  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  37.36 
 
 
229 aa  46.6  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  34.65 
 
 
304 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  27.94 
 
 
412 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  32.88 
 
 
197 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  42.11 
 
 
282 aa  43.9  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  35.37 
 
 
286 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3383  cell wall hydrolase, SleB  36.17 
 
 
208 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  30 
 
 
233 aa  42.7  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>