76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1671 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1671  cell wall hydrolase SleB  100 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.535782  decreased coverage  0.0020174 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  57.14 
 
 		 226 aa  206  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6696  cell wall hydrolase SleB  56.52 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2922  cell wall hydrolase SleB  57.4 
 
 		 245 aa  180  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0765  cell wall hydrolase SleB  69.75 
 
 		 315 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.769298  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1223  cell wall hydrolase family protein  67.5 
 
 		 284 aa  173  9.999999999999999e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0182396  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2798  cell wall hydrolase SleB  60.28 
 
 		 245 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3026  cell wall hydrolase SleB  60.28 
 
 		 245 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0983766  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0543  cell wall hydrolase, SleB  66.1 
 
 		 169 aa  171  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2145  putative lipoprotein  65.55 
 
 		 326 aa  169  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1928  cell wall hydrolase, SleB  59.5 
 
 		 169 aa  168  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.397103  normal  0.0105522 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2059  putative lipoprotein  65.55 
 
 		 326 aa  168  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.332093  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5847  cell wall hydrolase SleB  53.05 
 
 		 287 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0934  cell wall hydrolase, SleB  62.61 
 
 		 169 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0249675  normal  0.838276 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2496  hypothetical protein  61.21 
 
 		 166 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1894  hypothetical protein  67.89 
 
 		 129 aa  161  7e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6759  cell wall hydrolase SleB  50.89 
 
 		 278 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.582595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  36 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  34.33 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  34.33 
 
 		 240 aa  65.1  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  28.03 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  38.61 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  34.31 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  31.58 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0607  cell wall hydrolase, SleB  28.17 
 
 		 376 aa  59.7  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.356113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  33.58 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1044  cell wall hydrolase, SleB  32 
 
 		 380 aa  58.9  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  30.46 
 
 		 409 aa  58.2  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  31.65 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  26.67 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  30.16 
 
 		 410 aa  54.7  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  28.3 
 
 		 375 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  32.04 
 
 		 301 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  29.85 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  33.33 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  28.69 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  31.07 
 
 		 301 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  31.07 
 
 		 301 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  41.82 
 
 		 391 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  27.95 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  28.57 
 
 		 402 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  30.47 
 
 		 466 aa  52  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  28.21 
 
 		 460 aa  51.6  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3383  cell wall hydrolase, SleB  30.51 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02539  cell Wall Hydrolase superfamily  27.48 
 
 		 153 aa  51.6  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  29.19 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  30.69 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  38.98 
 
 		 383 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  28.89 
 
 		 365 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  33.33 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  30.7 
 
 		 163 aa  49.3  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  26.32 
 
 		 412 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2350  cell wall hydrolase, SleB  29.5 
 
 		 147 aa  48.9  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000225422  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  46.77 
 
 		 433 aa  48.9  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2483  cell wall hydrolase SleB  31.25 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.539309  normal  0.112371 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  29.03 
 
 		 277 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  26.86 
 
 		 255 aa  48.1  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2593  cell wall hydrolase SleB  28.8 
 
 		 432 aa  48.5  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  30.08 
 
 		 409 aa  48.5  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  34.83 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  29.6 
 
 		 476 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  28.57 
 
 		 476 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  40 
 
 		 446 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  32.65 
 
 		 496 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  29.23 
 
 		 404 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1225  cell wall hydrolase, SleB  28.57 
 
 		 474 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.31402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0796  cell wall hydrolase SleB  27.13 
 
 		 152 aa  45.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.138978 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  37.31 
 
 		 546 aa  45.8  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1104  cell wall hydrolase, SleB  28.48 
 
 		 472 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  35.19 
 
 		 231 aa  45.4  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  30.19 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  27.46 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  39.58 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  35.37 
 
 		 231 aa  42.4  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  29.79 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>