113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2593 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2593  cell wall hydrolase SleB  100 
 
 
432 aa  862    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  61.08 
 
 
466 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  59.47 
 
 
460 aa  241  2e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  61.02 
 
 
476 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1104  cell wall hydrolase, SleB  69.13 
 
 
472 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  59.24 
 
 
476 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1225  cell wall hydrolase, SleB  69.13 
 
 
474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.31402  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  50.39 
 
 
446 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  52.76 
 
 
404 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  54.33 
 
 
377 aa  160  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  50.33 
 
 
409 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  54.4 
 
 
391 aa  158  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  54.69 
 
 
402 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  50.38 
 
 
365 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  50.39 
 
 
301 aa  156  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  50.39 
 
 
301 aa  156  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  49.61 
 
 
301 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  50.39 
 
 
410 aa  155  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  54.33 
 
 
429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  52.31 
 
 
433 aa  152  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  49.34 
 
 
429 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  51.2 
 
 
383 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  43.8 
 
 
375 aa  131  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  46.09 
 
 
214 aa  122  8e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  42.65 
 
 
412 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  38.35 
 
 
409 aa  120  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  45.24 
 
 
229 aa  120  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  42.75 
 
 
245 aa  119  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  45.04 
 
 
230 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0607  cell wall hydrolase, SleB  42.11 
 
 
376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.356113  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  45.6 
 
 
255 aa  109  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1044  cell wall hydrolase, SleB  40.58 
 
 
380 aa  108  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  43.55 
 
 
240 aa  97.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  43.55 
 
 
240 aa  96.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  41.73 
 
 
221 aa  94  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  41.94 
 
 
228 aa  92.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  40.16 
 
 
179 aa  88.6  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2483  cell wall hydrolase SleB  36.29 
 
 
203 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.539309  normal  0.112371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3383  cell wall hydrolase, SleB  35.81 
 
 
208 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  35.57 
 
 
207 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  36.51 
 
 
203 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  35.71 
 
 
217 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  35.71 
 
 
203 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  37.1 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  36.36 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  25.99 
 
 
241 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6696  cell wall hydrolase SleB  30.53 
 
 
235 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  36.8 
 
 
187 aa  57.4  0.0000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  27.08 
 
 
189 aa  56.6  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6759  cell wall hydrolase SleB  40.32 
 
 
278 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.582595  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  55.56 
 
 
259 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  55.56 
 
 
253 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  55.56 
 
 
253 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  55.56 
 
 
253 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2496  hypothetical protein  51.06 
 
 
166 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  55.56 
 
 
253 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  55.56 
 
 
259 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  29.77 
 
 
226 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  55.56 
 
 
259 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  55.56 
 
 
259 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  55.56 
 
 
253 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  55.56 
 
 
253 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0934  cell wall hydrolase, SleB  48.98 
 
 
169 aa  53.9  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0249675  normal  0.838276 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  56.82 
 
 
231 aa  53.5  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0543  cell wall hydrolase, SleB  51.11 
 
 
169 aa  53.5  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  32.28 
 
 
234 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02539  cell Wall Hydrolase superfamily  30.53 
 
 
153 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  51.11 
 
 
239 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  31.97 
 
 
267 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1223  cell wall hydrolase family protein  45.65 
 
 
284 aa  50.8  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0182396  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2059  putative lipoprotein  30 
 
 
326 aa  50.8  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.332093  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0765  cell wall hydrolase SleB  44 
 
 
315 aa  50.8  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.769298  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  27.86 
 
 
546 aa  51.2  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  50 
 
 
310 aa  50.8  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  53.33 
 
 
247 aa  50.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  52.17 
 
 
231 aa  50.1  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5847  cell wall hydrolase SleB  43.75 
 
 
287 aa  49.7  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374564  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  29.69 
 
 
270 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  52.27 
 
 
165 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  32.12 
 
 
233 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2145  putative lipoprotein  40.82 
 
 
326 aa  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  30.95 
 
 
194 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  41.67 
 
 
197 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  52.27 
 
 
242 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  27.33 
 
 
267 aa  47.4  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1928  cell wall hydrolase, SleB  42.55 
 
 
169 aa  47.4  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.397103  normal  0.0105522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2798  cell wall hydrolase SleB  33 
 
 
245 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3026  cell wall hydrolase SleB  33 
 
 
245 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0983766  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2922  cell wall hydrolase SleB  34 
 
 
245 aa  47  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  43.18 
 
 
264 aa  47  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1894  hypothetical protein  53.85 
 
 
129 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  30.16 
 
 
216 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2760  hypothetical protein  54.05 
 
 
136 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  28.4 
 
 
239 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  31.67 
 
 
185 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 
265 aa  44.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  33.33 
 
 
265 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  33.9 
 
 
265 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  33.9 
 
 
265 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  33.33 
 
 
265 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>