83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2350 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2350  cell wall hydrolase, SleB  100 
 
 		 147 aa  311  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000225422  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1357  cell wall hydrolase, SleB  58.5 
 
 		 147 aa  194  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.527698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5438  cell wall hydrolase  28.47 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  33.83 
 
 		 310 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5373  cell wall hydrolase SleB  27.61 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5485  cell wall hydrolase  27.74 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5640  cell wall hydrolase  27.74 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5241  cell wall hydrolase  27.74 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.126095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5071  cell wall hydrolase; cortex lytic enzyme  27.74 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0510277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5183  cell wall hydrolase SleB  27.74 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  34.86 
 
 		 286 aa  52  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  32.58 
 
 		 241 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  33.59 
 
 		 239 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  36.52 
 
 		 546 aa  51.6  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  31.82 
 
 		 229 aa  52  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3911  cell wall hydrolase SleB  27.01 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5513  cell wall hydrolase  27.01 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5088  cell wall hydrolase; cortex lytic enzyme  27.01 
 
 		 140 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000764028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5569  cell wall hydrolase  27.01 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5519  cell wall hydrolase  27.01 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2186  cell wall hydrolase, SleB  37.68 
 
 		 190 aa  50.1  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  33.58 
 
 		 228 aa  49.7  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  33.82 
 
 		 231 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  31.34 
 
 		 197 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  29.1 
 
 		 200 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2662  putative spore-cortex-lytic enzyme  29.1 
 
 		 200 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2341  cell wall hydrolase  28.68 
 
 		 142 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2542  cell wall hydrolase SleB  28.68 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0951655  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2652  cell wall hydrolase  28.68 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0022634  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2612  cell wall hydrolase  28.68 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000069334 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  31.09 
 
 		 277 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2417  cell wall hydrolase  28.68 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0159574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2594  cell wall hydrolase  28.68 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2376  cell wall hydrolase  28.68 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  36.45 
 
 		 226 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2568  cell wall hydrolase  28.68 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2756  cell wall hydrolase  28.68 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000284234 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  29.63 
 
 		 233 aa  46.2  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  44.83 
 
 		 264 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  34.86 
 
 		 224 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  32.82 
 
 		 234 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3475  cell wall hydrolase SleB  28.47 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  30.83 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  30.3 
 
 		 267 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  30.17 
 
 		 265 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2614  cell wall hydrolase  27.94 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0113298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  30.17 
 
 		 265 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.55 
 
 		 253 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  50 
 
 		 265 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  33.33 
 
 		 235 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.55 
 
 		 253 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  29.55 
 
 		 270 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  50 
 
 		 265 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  50 
 
 		 265 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.55 
 
 		 259 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  50 
 
 		 265 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  50 
 
 		 265 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  50 
 
 		 265 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  29.55 
 
 		 259 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  48.72 
 
 		 265 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.55 
 
 		 259 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.55 
 
 		 259 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  33.33 
 
 		 247 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 		 194 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.55 
 
 		 253 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  31.54 
 
 		 282 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.55 
 
 		 253 aa  42.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  29.55 
 
 		 253 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  29.55 
 
 		 253 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  33.33 
 
 		 236 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  33.94 
 
 		 185 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3366  cell wall hydrolase SleB  27.21 
 
 		 143 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.015615  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  50 
 
 		 197 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  30.77 
 
 		 265 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  30.3 
 
 		 239 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  33.57 
 
 		 402 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  39.06 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  28.57 
 
 		 234 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  26.52 
 
 		 242 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  29.73 
 
 		 267 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  36.22 
 
 		 412 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  27.27 
 
 		 242 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2922  cell wall hydrolase SleB  30.94 
 
 		 245 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>