83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0607 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0607  cell wall hydrolase, SleB  100 
 
 		 376 aa  749    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.356113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  60.84 
 
 		 409 aa  193  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  40.4 
 
 		 412 aa  166  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  45.02 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1044  cell wall hydrolase, SleB  47.62 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  46.4 
 
 		 433 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  50 
 
 		 255 aa  126  8.000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  43.7 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  43.7 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  44.27 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  43.28 
 
 		 301 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  40.26 
 
 		 402 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  43.85 
 
 		 429 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  38.12 
 
 		 409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  43.65 
 
 		 429 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  38.97 
 
 		 446 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  41.48 
 
 		 365 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  42.4 
 
 		 410 aa  119  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  37.09 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  41.91 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  42.86 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  39.56 
 
 		 460 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2593  cell wall hydrolase SleB  42.11 
 
 		 432 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  42.22 
 
 		 466 aa  110  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  40.82 
 
 		 476 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  39.86 
 
 		 245 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  39.22 
 
 		 496 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  40.98 
 
 		 230 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1104  cell wall hydrolase, SleB  39.04 
 
 		 472 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  41.8 
 
 		 214 aa  103  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  38.36 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1225  cell wall hydrolase, SleB  37.67 
 
 		 474 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.31402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  35.14 
 
 		 207 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  43.44 
 
 		 179 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  40.16 
 
 		 240 aa  93.6  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  40.16 
 
 		 240 aa  93.2  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  37.7 
 
 		 229 aa  92.8  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  39.34 
 
 		 228 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3383  cell wall hydrolase, SleB  35.25 
 
 		 208 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  33.61 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2483  cell wall hydrolase SleB  32.79 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.539309  normal  0.112371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  32.79 
 
 		 217 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  32.79 
 
 		 203 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  32.06 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  35.38 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  39.84 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  31.97 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6696  cell wall hydrolase SleB  29.71 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2922  cell wall hydrolase SleB  30.22 
 
 		 245 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2798  cell wall hydrolase SleB  29.46 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3026  cell wall hydrolase SleB  29.46 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0983766  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2760  hypothetical protein  49.06 
 
 		 136 aa  60.8  0.00000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0543  cell wall hydrolase, SleB  36.73 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1223  cell wall hydrolase family protein  31.54 
 
 		 284 aa  59.3  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0182396  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5847  cell wall hydrolase SleB  27.36 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0765  cell wall hydrolase SleB  27.82 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.769298  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2059  putative lipoprotein  27.41 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.332093  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2145  putative lipoprotein  28.68 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6759  cell wall hydrolase SleB  26.58 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.582595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2496  hypothetical protein  32.65 
 
 		 166 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1894  hypothetical protein  36.56 
 
 		 129 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  35.29 
 
 		 216 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  28.21 
 
 		 189 aa  53.1  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1671  cell wall hydrolase SleB  28.17 
 
 		 208 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.535782  decreased coverage  0.0020174 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  29.63 
 
 		 203 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0934  cell wall hydrolase, SleB  31.63 
 
 		 169 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0249675  normal  0.838276 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  29.25 
 
 		 187 aa  49.7  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  34.69 
 
 		 228 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  28.89 
 
 		 194 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  30.89 
 
 		 197 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  32.8 
 
 		 310 aa  47  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  30.4 
 
 		 197 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  31.67 
 
 		 235 aa  46.2  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1928  cell wall hydrolase, SleB  28.87 
 
 		 169 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.397103  normal  0.0105522 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  26.36 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  51.16 
 
 		 270 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  32.28 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  50 
 
 		 267 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  32.52 
 
 		 247 aa  43.9  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  36.9 
 
 		 546 aa  43.5  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  30.33 
 
 		 234 aa  42.7  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  30.58 
 
 		 286 aa  42.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  44.44 
 
 		 231 aa  42.7  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>