35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2760 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2760  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  273  8e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  52.83 
 
 		 412 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  55.56 
 
 		 409 aa  62.8  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0607  cell wall hydrolase, SleB  49.06 
 
 		 376 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.356113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1044  cell wall hydrolase, SleB  50 
 
 		 380 aa  62.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  50 
 
 		 375 aa  55.1  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  70 
 
 		 433 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  67.74 
 
 		 410 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  58.97 
 
 		 404 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  58.97 
 
 		 446 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  61.11 
 
 		 429 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  61.11 
 
 		 429 aa  50.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  55.56 
 
 		 383 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  64.52 
 
 		 365 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  55.56 
 
 		 409 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  55.56 
 
 		 402 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  58.33 
 
 		 377 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2593  cell wall hydrolase SleB  54.05 
 
 		 432 aa  47.4  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  55.56 
 
 		 391 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  54.05 
 
 		 245 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  60 
 
 		 301 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  60 
 
 		 301 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  58.06 
 
 		 301 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  56.67 
 
 		 214 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  60 
 
 		 229 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  47.22 
 
 		 476 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  51.52 
 
 		 240 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  47.22 
 
 		 476 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  51.52 
 
 		 240 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  44.44 
 
 		 496 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  51.52 
 
 		 228 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1225  cell wall hydrolase, SleB  47.22 
 
 		 474 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.31402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  47.22 
 
 		 460 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1104  cell wall hydrolase, SleB  47.22 
 
 		 472 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  47.22 
 
 		 466 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>