133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4323 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  100 
 
 
375 aa  751    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  46.12 
 
 
412 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0607  cell wall hydrolase, SleB  51.59 
 
 
376 aa  164  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.356113  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  55.07 
 
 
409 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  56.39 
 
 
429 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  54.89 
 
 
429 aa  159  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  48.41 
 
 
391 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  53.73 
 
 
365 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  48 
 
 
402 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  52.24 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  47.8 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  52.24 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  48 
 
 
409 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1044  cell wall hydrolase, SleB  50.35 
 
 
380 aa  146  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  51.13 
 
 
377 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  47.1 
 
 
255 aa  143  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  45.21 
 
 
496 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  47.79 
 
 
446 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  47.06 
 
 
404 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  48.46 
 
 
433 aa  138  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  45.93 
 
 
466 aa  136  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  42.47 
 
 
476 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  46.76 
 
 
383 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  47.24 
 
 
410 aa  133  6e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  46.21 
 
 
230 aa  132  7.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  45.19 
 
 
460 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2593  cell wall hydrolase SleB  43.8 
 
 
432 aa  130  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1104  cell wall hydrolase, SleB  43.15 
 
 
472 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  43.17 
 
 
476 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1225  cell wall hydrolase, SleB  41.78 
 
 
474 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.31402  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  44.8 
 
 
214 aa  125  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  48.84 
 
 
240 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  48.84 
 
 
240 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  48.8 
 
 
179 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  47.29 
 
 
228 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  42.96 
 
 
245 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  47.24 
 
 
221 aa  113  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  40.8 
 
 
229 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  40.32 
 
 
207 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  42.31 
 
 
220 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2483  cell wall hydrolase SleB  38.71 
 
 
203 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.539309  normal  0.112371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  38.71 
 
 
203 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3383  cell wall hydrolase, SleB  33.86 
 
 
208 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  37.1 
 
 
203 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  37.1 
 
 
217 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  42.19 
 
 
209 aa  94.4  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  36.17 
 
 
546 aa  70.1  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  35.38 
 
 
186 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  33.08 
 
 
187 aa  69.3  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  33.86 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  35.21 
 
 
203 aa  67  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  33.86 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  32.81 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2798  cell wall hydrolase SleB  34.88 
 
 
245 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  35.94 
 
 
197 aa  65.1  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3026  cell wall hydrolase SleB  34.88 
 
 
245 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0983766  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  33.95 
 
 
226 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6696  cell wall hydrolase SleB  36.89 
 
 
235 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2922  cell wall hydrolase SleB  34.11 
 
 
245 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  34.88 
 
 
310 aa  62.8  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  35.38 
 
 
234 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  31.5 
 
 
247 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  34.65 
 
 
239 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5847  cell wall hydrolase SleB  32.32 
 
 
287 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374564  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  31.71 
 
 
165 aa  60.1  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  32.28 
 
 
267 aa  59.7  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3512  cell wall hydrolase SleB  35.61 
 
 
400 aa  59.7  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000979534  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  30.28 
 
 
236 aa  59.7  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1223  cell wall hydrolase family protein  33.08 
 
 
284 aa  59.3  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0182396  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  35.48 
 
 
235 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0543  cell wall hydrolase, SleB  35.92 
 
 
169 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  29.92 
 
 
259 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.92 
 
 
253 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.92 
 
 
259 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.92 
 
 
253 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  29.92 
 
 
253 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  29.92 
 
 
253 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.92 
 
 
253 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  36 
 
 
242 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.92 
 
 
253 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.92 
 
 
259 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.92 
 
 
259 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  32.28 
 
 
216 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2059  putative lipoprotein  29.32 
 
 
326 aa  57  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.332093  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2496  hypothetical protein  34.65 
 
 
166 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  34.11 
 
 
228 aa  57  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  49.06 
 
 
239 aa  56.2  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1369  hypothetical protein  28.67 
 
 
478 aa  56.2  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238194 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  28.66 
 
 
264 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2145  putative lipoprotein  28.57 
 
 
326 aa  55.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  34.38 
 
 
286 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  36.8 
 
 
228 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  36 
 
 
197 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  38.27 
 
 
185 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0765  cell wall hydrolase SleB  28.89 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.769298  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2760  hypothetical protein  50 
 
 
136 aa  54.3  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  47.14 
 
 
233 aa  54.3  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  35.19 
 
 
194 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0734  cell wall hydrolase, SleB  31.2 
 
 
239 aa  53.9  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  36.89 
 
 
253 aa  53.5  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>