122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2483 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2483  cell wall hydrolase SleB  100 
 
 
203 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.539309  normal  0.112371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  85.22 
 
 
203 aa  348  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  84.24 
 
 
203 aa  341  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  84.24 
 
 
217 aa  340  8e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3383  cell wall hydrolase, SleB  72.16 
 
 
208 aa  260  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  50 
 
 
207 aa  211  4.9999999999999996e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  29.9 
 
 
214 aa  105  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  38.71 
 
 
375 aa  101  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  36.89 
 
 
230 aa  101  9e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  36.04 
 
 
228 aa  100  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  39.68 
 
 
240 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  39.68 
 
 
240 aa  99  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  38.21 
 
 
429 aa  97.1  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  38.21 
 
 
429 aa  95.1  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  36.07 
 
 
229 aa  94.7  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  37.1 
 
 
460 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  37.1 
 
 
466 aa  92.4  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  39.52 
 
 
391 aa  92.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  38.28 
 
 
410 aa  92.4  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  37.4 
 
 
409 aa  91.7  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  37.4 
 
 
402 aa  91.3  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  37.9 
 
 
476 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1225  cell wall hydrolase, SleB  35.48 
 
 
474 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.31402  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  36.11 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  35.77 
 
 
377 aa  90.1  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  36.64 
 
 
245 aa  89.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  36.29 
 
 
476 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  35.66 
 
 
179 aa  88.6  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  31.66 
 
 
433 aa  88.2  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  36.29 
 
 
496 aa  87.8  9e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  37.5 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2593  cell wall hydrolase SleB  36.29 
 
 
432 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  35.94 
 
 
446 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  37.5 
 
 
404 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  36.51 
 
 
409 aa  86.3  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  33.08 
 
 
301 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1104  cell wall hydrolase, SleB  35.48 
 
 
472 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  31.58 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 
365 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  31.58 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  31.62 
 
 
383 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0607  cell wall hydrolase, SleB  32.79 
 
 
376 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.356113  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  31.5 
 
 
412 aa  79.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  32.31 
 
 
255 aa  77.4  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1044  cell wall hydrolase, SleB  31.52 
 
 
380 aa  71.2  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  33.55 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1369  hypothetical protein  32.73 
 
 
478 aa  63.2  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6696  cell wall hydrolase SleB  30.56 
 
 
235 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  32.69 
 
 
226 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  34.75 
 
 
197 aa  59.3  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  40 
 
 
187 aa  59.3  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0543  cell wall hydrolase, SleB  32.69 
 
 
169 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  32.33 
 
 
209 aa  58.2  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2662  putative spore-cortex-lytic enzyme  28.93 
 
 
200 aa  57.4  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  37.4 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2496  hypothetical protein  31.25 
 
 
166 aa  57.4  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  29.49 
 
 
200 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0934  cell wall hydrolase, SleB  30.19 
 
 
169 aa  56.6  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0249675  normal  0.838276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  35 
 
 
286 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  34.68 
 
 
229 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2922  cell wall hydrolase SleB  35.24 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  32.62 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5847  cell wall hydrolase SleB  32.99 
 
 
287 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374564  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  35.9 
 
 
310 aa  52.8  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2798  cell wall hydrolase SleB  31.43 
 
 
245 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3026  cell wall hydrolase SleB  31.43 
 
 
245 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0983766  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1894  hypothetical protein  32.99 
 
 
129 aa  52  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  23.44 
 
 
189 aa  52  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  39.29 
 
 
253 aa  52  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  36.28 
 
 
239 aa  51.6  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1223  cell wall hydrolase family protein  32.65 
 
 
284 aa  51.6  0.000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0182396  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2059  putative lipoprotein  31.96 
 
 
326 aa  51.6  0.000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.332093  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1928  cell wall hydrolase, SleB  25.69 
 
 
169 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.397103  normal  0.0105522 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  32.26 
 
 
264 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  33.01 
 
 
270 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  33.01 
 
 
267 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  34.75 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_004310  BR2145  putative lipoprotein  30.93 
 
 
326 aa  50.1  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6759  cell wall hydrolase SleB  45.45 
 
 
278 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.582595  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0765  cell wall hydrolase SleB  44.44 
 
 
315 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.769298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  39.68 
 
 
265 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18530  hypothetical protein  27.93 
 
 
170 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.711957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.3 
 
 
253 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.3 
 
 
253 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  29.3 
 
 
253 aa  49.3  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.3 
 
 
253 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.3 
 
 
253 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  31.25 
 
 
259 aa  48.5  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  34.55 
 
 
546 aa  48.5  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  27.59 
 
 
247 aa  48.5  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 
185 aa  48.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  31.43 
 
 
228 aa  48.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  39.68 
 
 
265 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  36.76 
 
 
265 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  36.76 
 
 
265 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  36.76 
 
 
265 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  37.5 
 
 
265 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  39.68 
 
 
265 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  39.68 
 
 
265 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  36.76 
 
 
265 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>