92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2496 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2496  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  343  6e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0934  cell wall hydrolase, SleB  86.96 
 
 		 169 aa  283  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0249675  normal  0.838276 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0543  cell wall hydrolase, SleB  72.73 
 
 		 169 aa  233  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1928  cell wall hydrolase, SleB  74.26 
 
 		 169 aa  214  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.397103  normal  0.0105522 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1894  hypothetical protein  81.4 
 
 		 129 aa  214  5e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0765  cell wall hydrolase SleB  61.54 
 
 		 315 aa  183  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.769298  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2145  putative lipoprotein  63.08 
 
 		 326 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2059  putative lipoprotein  63.08 
 
 		 326 aa  179  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.332093  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1223  cell wall hydrolase family protein  63.87 
 
 		 284 aa  161  3e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0182396  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5847  cell wall hydrolase SleB  55.04 
 
 		 287 aa  158  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6759  cell wall hydrolase SleB  56.15 
 
 		 278 aa  158  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.582595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  58.97 
 
 		 226 aa  153  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1671  cell wall hydrolase SleB  58.02 
 
 		 208 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.535782  decreased coverage  0.0020174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6696  cell wall hydrolase SleB  54.03 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2922  cell wall hydrolase SleB  51.3 
 
 		 245 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3026  cell wall hydrolase SleB  50.43 
 
 		 245 aa  138  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0983766  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2798  cell wall hydrolase SleB  50.43 
 
 		 245 aa  138  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  35.56 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  39 
 
 		 365 aa  62  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  30.13 
 
 		 301 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  30.13 
 
 		 301 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  32.71 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  32.26 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1044  cell wall hydrolase, SleB  31.45 
 
 		 380 aa  59.7  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  32.03 
 
 		 446 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  33.87 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  32.31 
 
 		 410 aa  58.2  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  32.32 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  31.25 
 
 		 404 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  38.14 
 
 		 221 aa  57.4  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  33.06 
 
 		 409 aa  57.4  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  33.96 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  30.19 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  34.65 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2483  cell wall hydrolase SleB  31.25 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.539309  normal  0.112371 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  51.02 
 
 		 433 aa  57  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  32.26 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  31.45 
 
 		 409 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  31.82 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  34.35 
 
 		 466 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  32.74 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  34.31 
 
 		 460 aa  55.1  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  35 
 
 		 476 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2593  cell wall hydrolase SleB  51.06 
 
 		 432 aa  54.3  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1225  cell wall hydrolase, SleB  31.5 
 
 		 474 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.31402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0607  cell wall hydrolase, SleB  32.65 
 
 		 376 aa  53.9  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.356113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  32.04 
 
 		 391 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  29.31 
 
 		 189 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  32.8 
 
 		 240 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  28.83 
 
 		 229 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  34.29 
 
 		 240 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1104  cell wall hydrolase, SleB  31.5 
 
 		 472 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  50 
 
 		 496 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  27.43 
 
 		 217 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  27.43 
 
 		 203 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  44.23 
 
 		 255 aa  51.2  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  32.8 
 
 		 412 aa  51.2  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  25.41 
 
 		 207 aa  50.8  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  31 
 
 		 476 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  34.44 
 
 		 383 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  31.54 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0796  cell wall hydrolase SleB  27.05 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.138978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  31 
 
 		 377 aa  48.5  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02539  cell Wall Hydrolase superfamily  26.45 
 
 		 153 aa  48.5  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  42 
 
 		 231 aa  47  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  29.13 
 
 		 208 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  44 
 
 		 187 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5334  hypothetical protein  29.57 
 
 		 300 aa  45.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.632965  normal  0.811239 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  27.34 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  29 
 
 		 253 aa  44.3  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  33.78 
 
 		 259 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  33.78 
 
 		 259 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  33.78 
 
 		 259 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  26.67 
 
 		 310 aa  43.9  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  26.32 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  33.78 
 
 		 253 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  33.78 
 
 		 253 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  33.78 
 
 		 253 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3383  cell wall hydrolase, SleB  29 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  33.78 
 
 		 253 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  39.58 
 
 		 231 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5166  cell wall hydrolase SleB  29.7 
 
 		 250 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.847272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2662  putative spore-cortex-lytic enzyme  37.5 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  33.78 
 
 		 253 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  33.78 
 
 		 253 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  37.5 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  40 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  35 
 
 		 242 aa  42.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  32.43 
 
 		 259 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  32.43 
 
 		 247 aa  42  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  35.42 
 
 		 233 aa  40.4  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>