24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5166 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010335  Caul_5166  cell wall hydrolase SleB  100 
 
 
250 aa  489  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.847272  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5334  hypothetical protein  75.35 
 
 
300 aa  216  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.632965  normal  0.811239 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1369  hypothetical protein  30.99 
 
 
478 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238194 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  32.33 
 
 
286 aa  52.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  28.57 
 
 
200 aa  49.3  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  38.38 
 
 
197 aa  49.3  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  30.23 
 
 
229 aa  48.9  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  29.77 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2662  putative spore-cortex-lytic enzyme  28.57 
 
 
200 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0934  cell wall hydrolase, SleB  31 
 
 
169 aa  46.2  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0249675  normal  0.838276 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  32.35 
 
 
228 aa  45.4  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0543  cell wall hydrolase, SleB  30.69 
 
 
169 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  27.61 
 
 
194 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  34.65 
 
 
179 aa  44.3  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2496  hypothetical protein  29.7 
 
 
166 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  29.79 
 
 
235 aa  43.5  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  46.94 
 
 
189 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  31.62 
 
 
240 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  31.62 
 
 
240 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  31.65 
 
 
239 aa  42.4  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1928  cell wall hydrolase, SleB  28 
 
 
169 aa  42.7  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.397103  normal  0.0105522 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  29.59 
 
 
226 aa  42.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02539  cell Wall Hydrolase superfamily  31.54 
 
 
153 aa  42  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  31.25 
 
 
310 aa  42  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>