135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1158 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  100 
 
 		 207 aa  427  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3383  cell wall hydrolase, SleB  59.02 
 
 		 208 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  52.43 
 
 		 203 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  52.68 
 
 		 203 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3562  hypothetical protein  53.5 
 
 		 217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2483  cell wall hydrolase SleB  50 
 
 		 203 aa  211  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.539309  normal  0.112371 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  40.32 
 
 		 375 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  44.09 
 
 		 220 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  36.87 
 
 		 228 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  40.46 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  40.46 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  36.51 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  31.07 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  37.9 
 
 		 229 aa  99  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  38.69 
 
 		 245 aa  99  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0607  cell wall hydrolase, SleB  35.14 
 
 		 376 aa  98.2  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.356113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  36.22 
 
 		 383 aa  97.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  38.93 
 
 		 409 aa  95.9  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  37.8 
 
 		 412 aa  95.9  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  37.8 
 
 		 402 aa  94.7  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  34.71 
 
 		 429 aa  94  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  35.29 
 
 		 429 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  37.8 
 
 		 409 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  36.64 
 
 		 179 aa  92.8  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  39.06 
 
 		 391 aa  92  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  37.6 
 
 		 460 aa  91.7  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  31.84 
 
 		 377 aa  91.7  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  37.6 
 
 		 466 aa  91.3  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  35.26 
 
 		 365 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  37.4 
 
 		 446 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  40.32 
 
 		 433 aa  89.7  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  36.8 
 
 		 476 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  36.8 
 
 		 496 aa  88.2  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  36 
 
 		 476 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  36.89 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  37.4 
 
 		 404 aa  87  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  31.33 
 
 		 301 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  37.8 
 
 		 410 aa  86.3  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  31.33 
 
 		 301 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2593  cell wall hydrolase SleB  35.57 
 
 		 432 aa  85.5  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1225  cell wall hydrolase, SleB  34.4 
 
 		 474 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.31402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  31.29 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1104  cell wall hydrolase, SleB  34.4 
 
 		 472 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1044  cell wall hydrolase, SleB  33.6 
 
 		 380 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  32.37 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  35.33 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1369  hypothetical protein  36.69 
 
 		 478 aa  68.9  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238194 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  38.97 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  36.89 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  35.25 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  38.26 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  33.54 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  36.59 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  26.56 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  33.77 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  34.25 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  36.89 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  34.92 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  31.01 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  34.65 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  37.7 
 
 		 546 aa  63.2  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  34.15 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  35.48 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  28.24 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  37.7 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2922  cell wall hydrolase SleB  31.97 
 
 		 245 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  30 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  30 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  34.4 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.71 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.71 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  30 
 
 		 253 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  32.82 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  39.52 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.71 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2798  cell wall hydrolase SleB  31.15 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3026  cell wall hydrolase SleB  31.15 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0983766  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  26.67 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3512  cell wall hydrolase SleB  31.87 
 
 		 400 aa  57  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000979534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  29.41 
 
 		 253 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1223  cell wall hydrolase family protein  31.4 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0182396  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6696  cell wall hydrolase SleB  29.51 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  33.09 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0543  cell wall hydrolase, SleB  28.23 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  32.54 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  33.33 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  32.52 
 
 		 265 aa  55.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  32.52 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  32.52 
 
 		 265 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  32.52 
 
 		 265 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  32.52 
 
 		 265 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  32.52 
 
 		 265 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  32.52 
 
 		 265 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  31.75 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  32.52 
 
 		 265 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_004310  BR2145  putative lipoprotein  29.84 
 
 		 326 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2059  putative lipoprotein  29.84 
 
 		 326 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.332093  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5847  cell wall hydrolase SleB  34.13 
 
 		 287 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374564  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>