262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0449 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  100 
 
 
267 aa  551  1e-156  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  82.9 
 
 
270 aa  448  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  63.74 
 
 
259 aa  338  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  64.23 
 
 
253 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  64.23 
 
 
253 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  64.23 
 
 
253 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  63.85 
 
 
253 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  64.23 
 
 
259 aa  335  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  63.85 
 
 
253 aa  335  5e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  64.23 
 
 
253 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  64.23 
 
 
259 aa  334  7e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  64.23 
 
 
259 aa  334  7e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  67.49 
 
 
247 aa  332  5e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  46.28 
 
 
267 aa  225  5.0000000000000005e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  49.36 
 
 
234 aa  212  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  41.51 
 
 
228 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  45.31 
 
 
225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  47.39 
 
 
233 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  44.76 
 
 
224 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  44.02 
 
 
236 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  40.25 
 
 
228 aa  172  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  40.6 
 
 
239 aa  168  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  38.93 
 
 
231 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  57.81 
 
 
242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  58.87 
 
 
165 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  58.82 
 
 
185 aa  155  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  35.25 
 
 
242 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  59.48 
 
 
546 aa  151  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  57.76 
 
 
286 aa  149  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  42.51 
 
 
241 aa  146  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0734  cell wall hydrolase, SleB  56.67 
 
 
239 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  55 
 
 
197 aa  142  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  54.92 
 
 
310 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  52.34 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  32.81 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  32.08 
 
 
234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  45.93 
 
 
163 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  47.9 
 
 
239 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  51.22 
 
 
203 aa  122  6e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2662  putative spore-cortex-lytic enzyme  45.6 
 
 
200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  45.6 
 
 
200 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2186  cell wall hydrolase, SleB  50 
 
 
190 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  56.64 
 
 
231 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  46.28 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1335  cell wall hydrolase, SleB  45.38 
 
 
201 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0172896  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  43.65 
 
 
264 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  43.9 
 
 
194 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  43.41 
 
 
216 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  37.01 
 
 
197 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  41.04 
 
 
208 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  38.61 
 
 
265 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  43.65 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  37.34 
 
 
265 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  42.86 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  37.34 
 
 
265 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  37.34 
 
 
265 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  37.34 
 
 
265 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  37.34 
 
 
265 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  37.34 
 
 
265 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  42.86 
 
 
265 aa  96.3  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  42.62 
 
 
253 aa  95.9  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0147  cell wall hydrolase  43.09 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1251  cell wall hydrolase SleB  37.41 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  43.44 
 
 
267 aa  86.7  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  39.83 
 
 
277 aa  86.7  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2132  cell wall hydrolase SleB  35.21 
 
 
216 aa  85.9  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  32.48 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  40.52 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3512  cell wall hydrolase SleB  31.72 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000979534  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13950  hydrolase  60.71 
 
 
406 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  33.08 
 
 
429 aa  70.5  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  33.08 
 
 
429 aa  69.7  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0837  peptidoglycan binding domain-containing protein  60.71 
 
 
395 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.265707  normal  0.357261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6069  peptidoglycan binding domain-containing protein  58.93 
 
 
395 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.123389 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5404  peptidoglycan binding domain-containing protein  58.93 
 
 
398 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5493  peptidoglycan binding domain-containing protein  58.93 
 
 
398 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.306054  normal  0.340156 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5780  peptidoglycan binding domain-containing protein  58.93 
 
 
398 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103235  normal  0.0225993 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  32.5 
 
 
304 aa  67  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  32.28 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  33.86 
 
 
375 aa  66.6  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4234  cell wall hydrolase/autolysin  56.14 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  51.43 
 
 
396 aa  65.9  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  31.3 
 
 
402 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  32.31 
 
 
383 aa  65.1  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  32.82 
 
 
391 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  37.59 
 
 
214 aa  63.9  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7330  cell wall hydrolase/autolysin  54.39 
 
 
409 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.680147  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1188  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.67 
 
 
321 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  31.85 
 
 
377 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  32 
 
 
255 aa  63.5  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  54.39 
 
 
378 aa  63.5  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  35.71 
 
 
383 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  49.21 
 
 
379 aa  63.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  36.11 
 
 
229 aa  62.4  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.3 
 
 
382 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  30.77 
 
 
189 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.96 
 
 
323 aa  61.6  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  40 
 
 
204 aa  61.6  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  30.53 
 
 
409 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  33.33 
 
 
409 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>