126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1335 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1335  cell wall hydrolase, SleB  100 
 
 		 201 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0172896  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0039  spore cortex-lytic enzyme  58.41 
 
 		 242 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0042  spore cortex-lytic enzyme  53.6 
 
 		 228 aa  145  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.415977  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3195  cell wall hydrolase, SleB  58.41 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  48.55 
 
 		 239 aa  138  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05880  cell wall hydrolase SleB  50.76 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.84059e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  42.86 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2102  cell wall hydrolase, SleB  39.41 
 
 		 239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  44.44 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4849  spore cortex-lytic enzyme  47.86 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0894  cell wall hydrolase, SleB  45.45 
 
 		 235 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0202  cell wall hydrolase, SleB  51.28 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0990855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1949  cell wall hydrolase, SleB  46.4 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000201814  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11760  cell wall hydrolase SleB  51.67 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0630117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0734  cell wall hydrolase, SleB  45.24 
 
 		 239 aa  121  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3899  cell wall hydrolase SleB  44.53 
 
 		 165 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.244131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2415  cell wall hydrolase, SleB  49.11 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.528951  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0035  spore cortex-lytic enzyme  49.11 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0607  cell wall hydrolase, SleB  45.22 
 
 		 236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1881  cell wall hydrolase SleB  42.74 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.131836  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2186  cell wall hydrolase, SleB  47.66 
 
 		 190 aa  116  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0449  spore cortex-lytic enzyme  45.38 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1776  cell wall hydrolase SleB  43.61 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2662  putative spore-cortex-lytic enzyme  46.61 
 
 		 200 aa  112  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  39.2 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1560  spore cortex-lytic enzyme  48 
 
 		 225 aa  111  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2175  spore cortex-lytic enzyme  44.54 
 
 		 270 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2781  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.04 
 
 		 259 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120397  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  37.57 
 
 		 310 aa  111  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2802  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.04 
 
 		 259 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.45164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2760  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  37.04 
 
 		 259 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.542492  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2348  spore-cortex-lytic enzyme, putative  45.38 
 
 		 200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2553  spore cortex-lytic enzyme SleB  35.54 
 
 		 259 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0187217  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  35.85 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1793  cell wall hydrolase SleB  41.13 
 
 		 185 aa  109  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2532  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  39.86 
 
 		 253 aa  109  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000946366 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1897  spore cortex-lytic enzyme SleB  41.79 
 
 		 247 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0572878  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2756  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  39.16 
 
 		 253 aa  108  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000173118 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2483  spore cortex-lytic enzyme  39.85 
 
 		 253 aa  107  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0343693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2562  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  40.3 
 
 		 253 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00268297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2518  spore cortex-lytic enzyme  40.3 
 
 		 253 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2748  spore cortex-lytic enzyme prepeptide  40.3 
 
 		 253 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 		 253 aa  106  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3357  cell wall hydrolase SleB  38.55 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.17779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0899  cell wall hydrolase SleB  39.85 
 
 		 197 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1953  cell wall hydrolase, SleB  42.86 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  42.11 
 
 		 546 aa  104  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  46.15 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0054  cell wall hydrolase, SleB  41.41 
 
 		 261 aa  101  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000771521 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  39.82 
 
 		 277 aa  101  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  48.65 
 
 		 231 aa  101  8e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  41.79 
 
 		 267 aa  97.4  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  33.14 
 
 		 264 aa  97.1  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1251  cell wall hydrolase SleB  39.44 
 
 		 222 aa  94.7  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  40 
 
 		 304 aa  91.3  8e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1379  cell wall hydrolase SleB  40 
 
 		 262 aa  89  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  39.84 
 
 		 265 aa  88.6  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3862  putative cell wall hydrolase  38.21 
 
 		 265 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000210035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3795  cell wall hydrolase, putative  38.21 
 
 		 265 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000105599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  38.21 
 
 		 265 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  38.21 
 
 		 265 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  38.21 
 
 		 265 aa  85.9  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  38.21 
 
 		 265 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  38.21 
 
 		 265 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  37.4 
 
 		 265 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  38.21 
 
 		 265 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2132  cell wall hydrolase SleB  35.46 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0147  cell wall hydrolase  36.07 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3512  cell wall hydrolase SleB  36.43 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000979534  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  31.67 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  26.67 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5088  cell wall hydrolase; cortex lytic enzyme  30 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000764028  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5373  cell wall hydrolase SleB  28.81 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5513  cell wall hydrolase  30 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5519  cell wall hydrolase  30 
 
 		 140 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  31.9 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5569  cell wall hydrolase  30 
 
 		 140 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3911  cell wall hydrolase SleB  29.17 
 
 		 140 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3002  cell wall hydrolase SleB  31.62 
 
 		 488 aa  52.4  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000336661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5183  cell wall hydrolase SleB  29.17 
 
 		 140 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5438  cell wall hydrolase  28.33 
 
 		 140 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5241  cell wall hydrolase  29.41 
 
 		 140 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.126095  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5071  cell wall hydrolase; cortex lytic enzyme  29.41 
 
 		 140 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0510277  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5640  cell wall hydrolase  29.41 
 
 		 140 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5485  cell wall hydrolase  29.41 
 
 		 140 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  30.77 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  34.48 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2359  cell wall hydrolase SleB  34.91 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.553857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2568  cell wall hydrolase  27.73 
 
 		 142 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  25.73 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2756  cell wall hydrolase  27.73 
 
 		 142 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000284234 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2341  cell wall hydrolase  26.89 
 
 		 142 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2417  cell wall hydrolase  26.89 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0159574  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2376  cell wall hydrolase  26.89 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2594  cell wall hydrolase  26.89 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  30.25 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2542  cell wall hydrolase SleB  26.89 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0951655  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2612  cell wall hydrolase  26.89 
 
 		 142 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000069334 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  30.51 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  26.56 
 
 		 391 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>