74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3186 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3186  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  59.72 
 
 		 332 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  56.94 
 
 		 297 aa  88.6  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35340  negative regulator of beta-lactamase expression  32.39 
 
 		 311 aa  86.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5184  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  35.27 
 
 		 279 aa  82  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.57 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2393  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  31.65 
 
 		 268 aa  72  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.27 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2719  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  33.73 
 
 		 274 aa  68.6  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4840  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  31.74 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1929  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  29.59 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  31.45 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3182  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  28.19 
 
 		 375 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209082 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1197  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.3 
 
 		 667 aa  59.7  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3174  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  32.56 
 
 		 694 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15405  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3907  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  37.82 
 
 		 648 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1928  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  29.38 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2914  hypothetical protein  38.24 
 
 		 659 aa  57.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2561  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.72 
 
 		 784 aa  55.8  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  29.38 
 
 		 370 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4945  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  30.91 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.89 
 
 		 959 aa  53.9  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0099  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  31.77 
 
 		 552 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1925  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase  30.41 
 
 		 289 aa  52.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0536095  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5274  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  30.3 
 
 		 224 aa  52.4  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.4 
 
 		 319 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  26.23 
 
 		 879 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  27.75 
 
 		 928 aa  50.8  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2816  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.24 
 
 		 542 aa  48.9  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0196  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  26.78 
 
 		 502 aa  48.9  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.86 
 
 		 327 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2916  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  47.92 
 
 		 864 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.260808  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  28.72 
 
 		 537 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  28.72 
 
 		 537 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  45.28 
 
 		 450 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  28.72 
 
 		 537 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  40 
 
 		 2277 aa  47  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0417  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.81 
 
 		 905 aa  47  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.46141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2387  gamma-D-glutamyl-{L}-meso-diaminopimelate peptidase I. metallo peptidase. MEROPS family M14C  44.64 
 
 		 423 aa  46.2  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  34.33 
 
 		 317 aa  46.2  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.33 
 
 		 332 aa  45.8  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2558  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  25.43 
 
 		 728 aa  45.8  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4855  cell wall hydrolase/autolysin  28.49 
 
 		 396 aa  45.8  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.62 
 
 		 322 aa  45.4  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.4 
 
 		 794 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.469744  normal  0.0598623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.06 
 
 		 1072 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2566  spore cortex-lytic enzyme SleC  40.28 
 
 		 438 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1624  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 270 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.958016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34600  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.86 
 
 		 387 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.123006  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  26.32 
 
 		 539 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  30.14 
 
 		 454 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.33 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2857  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.94 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0199  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.15 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.691121  normal  0.116846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4701  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.76 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.997176  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11630  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.31 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  38.03 
 
 		 383 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.29 
 
 		 323 aa  44.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2624  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  24.69 
 
 		 950 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3497  peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.84 
 
 		 182 aa  43.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.89 
 
 		 372 aa  43.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16840  hypothetical protein  26.01 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3755  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.94 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3704  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.94 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  26.84 
 
 		 539 aa  43.1  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  40 
 
 		 225 aa  42.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1539  twin-arginine translocation pathway signal  28.57 
 
 		 486 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.407284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2885  spore cortex-lytic enzyme SleC  38.89 
 
 		 438 aa  42.4  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  31.58 
 
 		 324 aa  42  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  25.41 
 
 		 654 aa  42  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3789  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.41 
 
 		 591 aa  42  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  40.3 
 
 		 378 aa  42  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4980  peptidoglycan binding domain-containing protein  37.29 
 
 		 128 aa  42  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>