74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2561 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2561  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  100 
 
 		 784 aa  1556    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2558  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  48.43 
 
 		 728 aa  556  1e-157  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2562  SpoIID/LytB domain protein  73.03 
 
 		 711 aa  548  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2520  hydrophobic protein  49.48 
 
 		 461 aa  266  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.534739  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  45.2 
 
 		 879 aa  259  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3274  hydrophobic protein  46.91 
 
 		 347 aa  254  4.0000000000000004e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1941  hypothetical protein  46.1 
 
 		 537 aa  246  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1068  hydrophobic  45.39 
 
 		 536 aa  228  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1206  hypothetical protein  40.8 
 
 		 854 aa  222  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  36.82 
 
 		 928 aa  188  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0417  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.61 
 
 		 905 aa  176  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.46141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3174  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  37.67 
 
 		 694 aa  172  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15405  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0196  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  37.65 
 
 		 502 aa  171  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  34.02 
 
 		 537 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  34.02 
 
 		 537 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  34.02 
 
 		 537 aa  162  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1023  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  31.83 
 
 		 636 aa  157  7e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34600  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.28 
 
 		 387 aa  150  9e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.123006  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  33.24 
 
 		 541 aa  147  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.58 
 
 		 959 aa  143  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  30.21 
 
 		 539 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0099  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  33.03 
 
 		 552 aa  142  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  34.89 
 
 		 654 aa  142  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  37.14 
 
 		 539 aa  139  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3789  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.23 
 
 		 591 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  35.43 
 
 		 370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20080  LysM domain-containing protein  30.43 
 
 		 695 aa  125  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2719  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  38.26 
 
 		 274 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  32.91 
 
 		 794 aa  113  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.469744  normal  0.0598623 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2868  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.27 
 
 		 540 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4840  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  37.44 
 
 		 277 aa  110  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2393  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  34.17 
 
 		 268 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2816  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  30.88 
 
 		 542 aa  102  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2624  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.7 
 
 		 950 aa  101  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1925  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase  31.65 
 
 		 289 aa  95.9  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0536095  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0009  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.07 
 
 		 684 aa  96.3  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3432  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.24 
 
 		 964 aa  95.1  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0164906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1928  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  33.01 
 
 		 391 aa  92.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1610  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.55 
 
 		 964 aa  92  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1539  twin-arginine translocation pathway signal  32.67 
 
 		 486 aa  90.9  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.407284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35340  negative regulator of beta-lactamase expression  31.49 
 
 		 311 aa  90.9  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.5 
 
 		 1072 aa  89.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2459  hypothetical protein  37.69 
 
 		 438 aa  87.8  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.218343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4945  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  31.53 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1929  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  30.81 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.06 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.78 
 
 		 223 aa  72  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.41 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16840  hypothetical protein  30.69 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5070  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.57 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212369  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0455  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  31.8 
 
 		 357 aa  66.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5274  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  29.65 
 
 		 224 aa  65.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0270  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.96 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3434  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.28 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0021339  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0459  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.72 
 
 		 1070 aa  60.8  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3182  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  26.47 
 
 		 375 aa  59.7  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209082 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3186  hypothetical protein  29.26 
 
 		 256 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0545  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.4 
 
 		 157 aa  54.3  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3053  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24 
 
 		 792 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0646042 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0529  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase, putative  28.4 
 
 		 222 aa  53.9  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.549299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3698  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.89 
 
 		 150 aa  50.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.694196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3428  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.89 
 
 		 150 aa  50.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3745  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.88 
 
 		 150 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5184  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  24.57 
 
 		 279 aa  48.5  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1572  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.71 
 
 		 150 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.577314  normal  0.236623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2671  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  23.04 
 
 		 792 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342561  normal  0.283165 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3340  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.21 
 
 		 152 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3389  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.21 
 
 		 152 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0561834  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3648  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.21 
 
 		 150 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1669  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.95 
 
 		 173 aa  45.1  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.761458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3323  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  23.53 
 
 		 150 aa  45.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3670  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  22.93 
 
 		 152 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0492519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2303  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.07 
 
 		 157 aa  44.3  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3666  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  30.34 
 
 		 150 aa  44.3  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>