97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1188 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  100 
 
 		 794 aa  1566    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.469744  normal  0.0598623 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.36 
 
 		 959 aa  291  4e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2558  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  52.88 
 
 		 728 aa  268  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34600  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.21 
 
 		 387 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.123006  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  39.26 
 
 		 928 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  35.15 
 
 		 654 aa  164  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0417  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.11 
 
 		 905 aa  159  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.46141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0196  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  34.81 
 
 		 502 aa  153  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3789  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.21 
 
 		 591 aa  150  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1023  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  37.05 
 
 		 636 aa  149  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20080  LysM domain-containing protein  32.11 
 
 		 695 aa  147  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3174  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  36.52 
 
 		 694 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15405  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  34.88 
 
 		 879 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  33.64 
 
 		 539 aa  135  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  37.5 
 
 		 539 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0099  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  33.66 
 
 		 552 aa  130  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  34.35 
 
 		 541 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  29.15 
 
 		 537 aa  127  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  29.15 
 
 		 537 aa  127  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  29.15 
 
 		 537 aa  127  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  34.68 
 
 		 370 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2561  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  32.28 
 
 		 784 aa  120  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2624  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  32.37 
 
 		 950 aa  109  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0168  Peptidase M23  29.51 
 
 		 435 aa  99  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1610  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.6 
 
 		 964 aa  98.2  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.47 
 
 		 1072 aa  95.1  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3432  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.63 
 
 		 964 aa  92.4  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0164906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5070  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.91 
 
 		 353 aa  91.3  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212369  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0009  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  32.34 
 
 		 684 aa  89  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1179  SpoIID/LytB domain protein  36.99 
 
 		 658 aa  85.1  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1539  twin-arginine translocation pathway signal  35.64 
 
 		 486 aa  84.7  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.407284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3434  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  33.68 
 
 		 366 aa  80.5  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0021339  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2571  FG-GAP repeat protein  30.12 
 
 		 456 aa  80.1  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2570  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.16 
 
 		 571 aa  75.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2569  FG-GAP repeat protein  31.3 
 
 		 685 aa  75.5  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.618986  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2393  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  31.28 
 
 		 268 aa  72.4  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2719  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  30.33 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0270  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.55 
 
 		 364 aa  70.5  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3665  SCP-like extracellular protein  23.87 
 
 		 594 aa  69.7  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0455  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.61 
 
 		 357 aa  67.4  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35340  negative regulator of beta-lactamase expression  29.57 
 
 		 311 aa  65.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  30.05 
 
 		 223 aa  65.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2816  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.85 
 
 		 542 aa  65.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.03 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  25.11 
 
 		 1019 aa  63.9  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1925  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase  30.91 
 
 		 289 aa  62.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0536095  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4840  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  29.41 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  27.75 
 
 		 1490 aa  61.6  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  28.91 
 
 		 1126 aa  60.8  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  28.89 
 
 		 813 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16840  hypothetical protein  27.57 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4945  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.66 
 
 		 273 aa  56.2  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1929  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  27.75 
 
 		 223 aa  56.2  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  30.69 
 
 		 412 aa  55.8  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  26.64 
 
 		 872 aa  55.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.43 
 
 		 1222 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  27.35 
 
 		 554 aa  54.7  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3878  Allergen V5/Tpx-1 family protein  24.44 
 
 		 588 aa  54.3  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.17 
 
 		 1236 aa  53.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1928  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  25.13 
 
 		 391 aa  53.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8159  hypothetical protein  24.53 
 
 		 293 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.88 
 
 		 356 aa  52.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2303  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.22 
 
 		 157 aa  52.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.88 
 
 		 1154 aa  52  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.69 
 
 		 1118 aa  52  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.02 
 
 		 891 aa  52  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3745  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.07 
 
 		 150 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1669  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.73 
 
 		 173 aa  51.6  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.761458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3428  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.16 
 
 		 150 aa  50.8  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3698  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.16 
 
 		 150 aa  50.8  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.694196  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  26.29 
 
 		 3197 aa  51.2  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0530  hypothetical protein  21.61 
 
 		 1210 aa  50.8  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0010082  normal  0.0887655 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3404  domain of unknown function DUF1735  26.7 
 
 		 411 aa  50.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00777972  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3340  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.67 
 
 		 152 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3648  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.67 
 
 		 150 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.53 
 
 		 2194 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3389  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.67 
 
 		 152 aa  50.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0561834  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  23.9 
 
 		 1124 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.31 
 
 		 1340 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.13 
 
 		 1009 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3670  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.29 
 
 		 152 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0492519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  26.55 
 
 		 760 aa  48.5  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  28.08 
 
 		 470 aa  48.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.33 
 
 		 1113 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  33.11 
 
 		 1638 aa  47.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2642  metallophosphoesterase  29.35 
 
 		 649 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0441775  normal  0.87277 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  26.04 
 
 		 3197 aa  47.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3182  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  25.25 
 
 		 375 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209082 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1572  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.5 
 
 		 150 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.577314  normal  0.236623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  33.61 
 
 		 828 aa  46.6  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.62 
 
 		 1225 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3323  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  28.06 
 
 		 150 aa  45.8  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3666  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  28.57 
 
 		 150 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  32.28 
 
 		 861 aa  45.8  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3186  hypothetical protein  28.4 
 
 		 256 aa  44.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  29.22 
 
 		 510 aa  45.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  27.46 
 
 		 690 aa  44.3  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>