12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1624 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1624  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 270 aa  553  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.958016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1612  peptidoglycan binding domain-containing protein  82.96 
 
 		 270 aa  441  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2857  peptidoglycan binding domain-containing protein  78.52 
 
 		 268 aa  441  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3704  peptidoglycan binding domain-containing protein  78.68 
 
 		 272 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3755  peptidoglycan binding domain-containing protein  78.68 
 
 		 272 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3969  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.09 
 
 		 232 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6382  hypothetical protein  33.1 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.136884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1641  hypothetical protein  33.96 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2529  hypothetical protein  31.11 
 
 		 787 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  37.5 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.94 
 
 		 332 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3186  hypothetical protein  37.5 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>