14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1612 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1612  peptidoglycan binding domain-containing protein  100 
 
 		 270 aa  553  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0214312 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1624  peptidoglycan binding domain-containing protein  82.96 
 
 		 270 aa  464  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.958016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2857  peptidoglycan binding domain-containing protein  81.48 
 
 		 268 aa  448  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3704  peptidoglycan binding domain-containing protein  81.25 
 
 		 272 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3755  peptidoglycan binding domain-containing protein  81.25 
 
 		 272 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3969  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.33 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6382  hypothetical protein  34.51 
 
 		 450 aa  58.9  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.136884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.94 
 
 		 332 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  35.94 
 
 		 297 aa  46.6  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2529  hypothetical protein  32.06 
 
 		 787 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1641  hypothetical protein  30.34 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.5 
 
 		 356 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3186  hypothetical protein  35.94 
 
 		 256 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>