137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5145 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  100 
 
 		 317 aa  634    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  37.02 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  38.97 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  34.95 
 
 		 239 aa  99.8  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  35.75 
 
 		 247 aa  93.6  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  38.69 
 
 		 225 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  45.87 
 
 		 223 aa  93.2  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  54.43 
 
 		 479 aa  85.5  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  55.41 
 
 		 399 aa  82.8  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  51.32 
 
 		 439 aa  79  0.00000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  46 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  41.41 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  41.41 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  41.41 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  38.61 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  50.63 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  41.41 
 
 		 107 aa  70.5  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  50.7 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  45.57 
 
 		 416 aa  70.1  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  33.13 
 
 		 762 aa  70.1  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  43.42 
 
 		 495 aa  69.7  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.86 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  47.14 
 
 		 397 aa  69.3  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.48 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  47.14 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  50 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  46.58 
 
 		 428 aa  67  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  47.5 
 
 		 205 aa  67  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  42 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  47.76 
 
 		 436 aa  66.2  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  53.23 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  51.56 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  36.63 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  30.85 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  38.46 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  40.2 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1959  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.09 
 
 		 487 aa  63.2  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315261  normal  0.0108797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  36.08 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  30.77 
 
 		 372 aa  62.8  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  38.24 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  38.24 
 
 		 152 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  38.24 
 
 		 152 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  51.25 
 
 		 366 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  42.47 
 
 		 171 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.59 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  42.86 
 
 		 499 aa  61.6  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  37.37 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  37.37 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1960  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.1 
 
 		 360 aa  60.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  37.37 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  46.38 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  35.05 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  34.26 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  38.89 
 
 		 256 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0221  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.67 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0446157  normal  0.633026 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  39.76 
 
 		 485 aa  58.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  39.02 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  34.51 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0960  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.3 
 
 		 575 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4245  transglycosylase-like  41.98 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  41.11 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  51.02 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  41.11 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  47.62 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  25.45 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  43.59 
 
 		 473 aa  56.2  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1166  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.29 
 
 		 412 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  41.11 
 
 		 547 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  35.35 
 
 		 154 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  38.46 
 
 		 461 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  36.26 
 
 		 228 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  28.11 
 
 		 462 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0528  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.08 
 
 		 334 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  37.21 
 
 		 328 aa  54.3  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  40 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  36.79 
 
 		 362 aa  53.9  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1970  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  26.71 
 
 		 160 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.607803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  38.6 
 
 		 297 aa  53.5  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  46.3 
 
 		 222 aa  53.1  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.98 
 
 		 1089 aa  52.8  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  28.57 
 
 		 332 aa  52.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  38.89 
 
 		 228 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2508  peptidoglycan binding domain-containing protein  45 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0275667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3186  hypothetical protein  34.25 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  34.31 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  40.85 
 
 		 433 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  34.31 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  40.85 
 
 		 433 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  34.31 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  40.85 
 
 		 431 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  32.73 
 
 		 375 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6585  transglycosylase domain-containing protein  39.76 
 
 		 128 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  38.96 
 
 		 372 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  33.64 
 
 		 375 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  32.73 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1886  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.05 
 
 		 635 aa  50.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  45.65 
 
 		 192 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  45.71 
 
 		 375 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4844  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.32 
 
 		 266 aa  49.7  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.38175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  37.29 
 
 		 211 aa  49.7  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>