99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0996 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  100 
 
 
212 aa  414  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  67.87 
 
 
231 aa  260  8.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  41.4 
 
 
223 aa  140  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  43.22 
 
 
228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  42.08 
 
 
205 aa  132  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  38.03 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  41.38 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  46.49 
 
 
228 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  48.59 
 
 
192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  54.78 
 
 
176 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  62.35 
 
 
387 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  63.44 
 
 
118 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  59.26 
 
 
107 aa  114  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  63.44 
 
 
118 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  63.44 
 
 
118 aa  114  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  47.2 
 
 
461 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  59.14 
 
 
181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  57.01 
 
 
106 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  62.03 
 
 
416 aa  113  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  59.14 
 
 
152 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  59.14 
 
 
152 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  51.01 
 
 
222 aa  111  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  60 
 
 
111 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  55.79 
 
 
372 aa  110  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  56.99 
 
 
171 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  56.99 
 
 
171 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  56.99 
 
 
171 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  61.25 
 
 
473 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  52.59 
 
 
350 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  61.73 
 
 
485 aa  106  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  44.14 
 
 
170 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  69.44 
 
 
188 aa  105  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  62.03 
 
 
375 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  62.03 
 
 
375 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  62.03 
 
 
375 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  62.34 
 
 
547 aa  104  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  62.34 
 
 
348 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  62.34 
 
 
348 aa  104  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  58.14 
 
 
153 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  59.49 
 
 
375 aa  102  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  65.28 
 
 
171 aa  102  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  58.23 
 
 
375 aa  102  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  49.59 
 
 
211 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  48.18 
 
 
170 aa  101  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  53.92 
 
 
154 aa  101  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  58.1 
 
 
407 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  50.38 
 
 
433 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  50.38 
 
 
431 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  50.38 
 
 
433 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  62.67 
 
 
466 aa  98.2  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  57.89 
 
 
439 aa  97.8  9e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  62.67 
 
 
444 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  56.58 
 
 
479 aa  96.7  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  48.36 
 
 
328 aa  94.7  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  56.41 
 
 
362 aa  94.7  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  54.76 
 
 
682 aa  91.7  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  45.8 
 
 
308 aa  90.1  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  54.67 
 
 
499 aa  85.1  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  43.93 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  43.55 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  49.35 
 
 
427 aa  80.5  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  61.76 
 
 
428 aa  79.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  51.25 
 
 
274 aa  79  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  55.41 
 
 
1409 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  55.88 
 
 
495 aa  78.6  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  46.84 
 
 
247 aa  78.2  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  45.36 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  48.05 
 
 
416 aa  76.3  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  51.47 
 
 
400 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  48.72 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  46.34 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  48.61 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  43.84 
 
 
436 aa  65.1  0.0000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  39.39 
 
 
317 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  45.21 
 
 
385 aa  62.4  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  43.84 
 
 
366 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  51.02 
 
 
256 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  42.03 
 
 
224 aa  58.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  44.07 
 
 
97 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  43.84 
 
 
375 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  40 
 
 
266 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  39.73 
 
 
409 aa  53.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  42.03 
 
 
399 aa  51.6  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2044  LysM domain/BON superfamily protein  34.48 
 
 
143 aa  50.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2152  Peptidoglycan-binding LysM  48.08 
 
 
334 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  32.54 
 
 
590 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11598  inv protein  72.22 
 
 
249 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.747429  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0518  LysM domain/BON superfamily protein  40.82 
 
 
168 aa  45.1  0.0008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000100124  decreased coverage  0.00200043 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0939  peptidoglycan-binding LysM  33.85 
 
 
309 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.013426  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1839  aggregation promoting factor-like surface protein  44.62 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0523  LysM domain/BON superfamily protein  40.82 
 
 
168 aa  44.7  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000072506  hitchhiker  0.00844539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4527  peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 
123 aa  43.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.292703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4808  Peptidoglycan-binding LysM  44.9 
 
 
235 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1153  Lyzozyme M1 (1,4-beta-N-acetylmuramidase)  40.82 
 
 
429 aa  42.4  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2273  Peptidoglycan-binding LysM  39.22 
 
 
546 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000673972  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4245  transglycosylase-like  36.59 
 
 
126 aa  42.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6585  transglycosylase domain-containing protein  36.67 
 
 
128 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  41.18 
 
 
307 aa  42.4  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1323  Peptidoglycan-binding LysM  36.54 
 
 
230 aa  41.6  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.6395e-23 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>