115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0974 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  100 
 
 
479 aa  928    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  43.56 
 
 
439 aa  289  8e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  39.96 
 
 
499 aa  245  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  45.26 
 
 
427 aa  243  7.999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  45.77 
 
 
436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  45.98 
 
 
416 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  42.15 
 
 
385 aa  215  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  38.06 
 
 
366 aa  196  6e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  41.64 
 
 
451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  39.46 
 
 
375 aa  189  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  35.25 
 
 
387 aa  186  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  37.82 
 
 
409 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  34.43 
 
 
375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  32.84 
 
 
461 aa  163  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  33.83 
 
 
375 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  32.09 
 
 
473 aa  151  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  33.33 
 
 
397 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  35.17 
 
 
547 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  31.63 
 
 
375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  31.63 
 
 
375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  31.63 
 
 
375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  36.46 
 
 
348 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  36.46 
 
 
348 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  33.85 
 
 
372 aa  140  3.9999999999999997e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  32.85 
 
 
485 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  33.6 
 
 
362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  29.72 
 
 
400 aa  133  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  36.47 
 
 
398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  34.09 
 
 
399 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  34.03 
 
 
428 aa  124  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  37.45 
 
 
266 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  28.86 
 
 
495 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  62.34 
 
 
266 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  32.74 
 
 
412 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  57.89 
 
 
223 aa  99.4  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  26.64 
 
 
479 aa  97.1  6e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  33.33 
 
 
391 aa  92  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  58.11 
 
 
225 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  59.46 
 
 
227 aa  90.5  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  55.26 
 
 
231 aa  89.7  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  57.97 
 
 
212 aa  89.4  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  50 
 
 
416 aa  85.9  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  54.43 
 
 
317 aa  86.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  60.29 
 
 
118 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  60.29 
 
 
118 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  57.75 
 
 
111 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  60.29 
 
 
118 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  30 
 
 
389 aa  85.5  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  27.92 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  54.93 
 
 
205 aa  84.3  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  60.29 
 
 
171 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  26.55 
 
 
460 aa  82.4  0.00000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  55.71 
 
 
205 aa  83.2  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  53.52 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  53.25 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  51.32 
 
 
239 aa  79.3  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  54.43 
 
 
107 aa  79.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  27.71 
 
 
347 aa  79  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  55.56 
 
 
106 aa  78.6  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  50 
 
 
247 aa  77  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  53.52 
 
 
224 aa  77  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  27.14 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  26.39 
 
 
389 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  27.13 
 
 
401 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  25.68 
 
 
406 aa  74.7  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  48.72 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  52.94 
 
 
171 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  52.94 
 
 
171 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  52.94 
 
 
171 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  49.3 
 
 
153 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  52.17 
 
 
154 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  47.89 
 
 
170 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  47.89 
 
 
170 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  50 
 
 
176 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  24.72 
 
 
343 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  50 
 
 
181 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  50 
 
 
152 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  50 
 
 
152 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  33.52 
 
 
448 aa  67.4  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  50 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  50.7 
 
 
211 aa  64.3  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  46.67 
 
 
444 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  29.88 
 
 
295 aa  63.2  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  45.33 
 
 
466 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  34.25 
 
 
682 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  45.45 
 
 
192 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  47.95 
 
 
256 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2093  hypothetical protein  34.51 
 
 
352 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00901653  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1828  3D domain protein  25.18 
 
 
329 aa  61.2  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.937918  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  43.42 
 
 
222 aa  60.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  45.33 
 
 
407 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6585  transglycosylase domain-containing protein  50 
 
 
128 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  32.17 
 
 
473 aa  60.5  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  43.59 
 
 
274 aa  60.1  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  44.16 
 
 
228 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  45.59 
 
 
224 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  27.8 
 
 
338 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  37.61 
 
 
325 aa  58.5  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4245  transglycosylase-like  50.82 
 
 
126 aa  58.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  24.64 
 
 
342 aa  57.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>