115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23910 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  832    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  35.94 
 
 		 461 aa  196  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  34.64 
 
 		 397 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  33.57 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  33.25 
 
 		 485 aa  175  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  33.25 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  33.33 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  33.85 
 
 		 479 aa  169  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  29.17 
 
 		 547 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  29.44 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  29.44 
 
 		 348 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  29.93 
 
 		 372 aa  159  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  30.02 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  30.02 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  30.02 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  29.34 
 
 		 375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  32.8 
 
 		 439 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  32.21 
 
 		 495 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  31.37 
 
 		 385 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  30.08 
 
 		 362 aa  136  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  33.84 
 
 		 428 aa  134  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  74.36 
 
 		 222 aa  130  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  30.02 
 
 		 375 aa  130  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  68.83 
 
 		 228 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  26.65 
 
 		 375 aa  126  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  61.11 
 
 		 350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  32.66 
 
 		 451 aa  120  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  36.49 
 
 		 499 aa  120  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  29.52 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  28.01 
 
 		 409 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  62.35 
 
 		 231 aa  116  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  68 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  63.64 
 
 		 211 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  62.67 
 
 		 466 aa  113  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  62.67 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  64 
 
 		 407 aa  111  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  53.93 
 
 		 682 aa  110  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  60.76 
 
 		 308 aa  109  8.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  61.04 
 
 		 228 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  67.95 
 
 		 256 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  60 
 
 		 433 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  60 
 
 		 433 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  60 
 
 		 431 aa  107  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  31.23 
 
 		 398 aa  106  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  58.33 
 
 		 212 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  53.33 
 
 		 223 aa  101  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  61.33 
 
 		 192 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  61.54 
 
 		 224 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  54.43 
 
 		 274 aa  100  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  28.81 
 
 		 427 aa  97.8  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  65.22 
 
 		 1409 aa  96.7  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  60.81 
 
 		 188 aa  94  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  60.98 
 
 		 107 aa  94  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  60 
 
 		 106 aa  94  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  52.94 
 
 		 205 aa  92.8  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  28.57 
 
 		 436 aa  92.8  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  55.42 
 
 		 205 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  59.15 
 
 		 181 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  53.49 
 
 		 118 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  53.49 
 
 		 118 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  53.49 
 
 		 118 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  59.15 
 
 		 152 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  59.15 
 
 		 152 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  52.27 
 
 		 111 aa  89  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  57.69 
 
 		 176 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  54.55 
 
 		 171 aa  87  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  60.56 
 
 		 171 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  60.56 
 
 		 171 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  60.56 
 
 		 171 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  62.16 
 
 		 153 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  58.11 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  50.6 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  47.44 
 
 		 266 aa  82.8  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  57.33 
 
 		 170 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  57.53 
 
 		 154 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  48 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  46.67 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  28.26 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  28.62 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  22.05 
 
 		 343 aa  72.8  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  34.45 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  44.74 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  45.07 
 
 		 325 aa  70.9  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  27.69 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  30.29 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  27.18 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  23.97 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  41.9 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  25.71 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  25.62 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  40 
 
 		 340 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  23.86 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0051  hypothetical protein  23.51 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000984601  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  28.51 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  39.02 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  24.19 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  32.98 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  40.43 
 
 		 338 aa  54.7  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0170  3D domain protein  37.97 
 
 		 356 aa  50.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  40.54 
 
 		 446 aa  50.1  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>