119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1956 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  100 
 
 		 192 aa  373  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  46.03 
 
 		 228 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  66.37 
 
 		 350 aa  137  7e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  45.95 
 
 		 228 aa  131  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  43.32 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  44 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  44.68 
 
 		 231 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  52.99 
 
 		 328 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  53.9 
 
 		 433 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  53.9 
 
 		 433 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  53.9 
 
 		 431 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  80 
 
 		 256 aa  124  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  38.94 
 
 		 205 aa  124  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  55.93 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  39.6 
 
 		 205 aa  122  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  61.62 
 
 		 407 aa  121  7e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  72.73 
 
 		 466 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  73.24 
 
 		 308 aa  119  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  61.11 
 
 		 106 aa  117  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  64.77 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  69.23 
 
 		 274 aa  117  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  67.57 
 
 		 348 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  67.57 
 
 		 348 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  67.57 
 
 		 547 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  58.42 
 
 		 444 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  38.64 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  64 
 
 		 372 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  56.44 
 
 		 375 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  56.44 
 
 		 375 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  56.44 
 
 		 375 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  66.2 
 
 		 375 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  58.67 
 
 		 485 aa  107  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  69.01 
 
 		 362 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  64.79 
 
 		 375 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  52.03 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  68.12 
 
 		 428 aa  105  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  56 
 
 		 152 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  56 
 
 		 152 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  60.53 
 
 		 461 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  55.75 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  61.33 
 
 		 416 aa  102  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  47.55 
 
 		 170 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  61.64 
 
 		 495 aa  99.4  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  49.53 
 
 		 118 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  49.53 
 
 		 118 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  49.53 
 
 		 118 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  55.21 
 
 		 107 aa  97.4  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  51.4 
 
 		 171 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  51.4 
 
 		 171 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  54.37 
 
 		 1409 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  51.92 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  51.4 
 
 		 171 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  48.96 
 
 		 473 aa  96.3  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  60.81 
 
 		 188 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  55.56 
 
 		 111 aa  94.4  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  49.53 
 
 		 153 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  56.63 
 
 		 682 aa  93.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  60.27 
 
 		 171 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  44.88 
 
 		 397 aa  91.3  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  58.33 
 
 		 400 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  43.22 
 
 		 154 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  47.22 
 
 		 387 aa  90.1  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  39.58 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  41.57 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  41.38 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  46.67 
 
 		 439 aa  64.3  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  45.45 
 
 		 479 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  44 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  46.75 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  42.86 
 
 		 436 aa  58.5  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  36.9 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  46.38 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  44.44 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  39.08 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  42.27 
 
 		 375 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  41.03 
 
 		 499 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  46.3 
 
 		 317 aa  52.8  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  41 
 
 		 366 aa  51.6  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  43.86 
 
 		 335 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  38.46 
 
 		 427 aa  50.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2785  LysM domain/BON superfamily protein  33.81 
 
 		 149 aa  48.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.267708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  36.71 
 
 		 224 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0459  LysM domain/BON superfamily protein  48.98 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02521  hypothetical protein  33.09 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1018  Peptidoglycan-binding LysM  33.09 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2800  LysM domain/BON superfamily protein  33.09 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2945  LysM domain/BON superfamily protein  33.09 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1041  LysM domain/BON superfamily protein  33.09 
 
 		 149 aa  47  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3216  LysM domain/BON superfamily protein  33.09 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3907  LysM domain/BON superfamily protein  33.09 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.979345  normal  0.391605 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02485  hypothetical protein  33.09 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  43.68 
 
 		 295 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  36.59 
 
 		 416 aa  46.2  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0939  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 309 aa  45.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.013426  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0518  LysM domain/BON superfamily protein  44.9 
 
 		 168 aa  45.4  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000100124  decreased coverage  0.00200043 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2992  LysM domain/BON superfamily protein  36.84 
 
 		 149 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.021376 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2975  LysM domain/BON superfamily protein  36.84 
 
 		 149 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.870465  normal  0.0673181 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2940  LysM domain/BON superfamily protein  36.84 
 
 		 149 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.137331 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2908  LysM domain/BON superfamily protein  36.84 
 
 		 149 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3097  LysM domain/BON superfamily protein  36.84 
 
 		 149 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>