103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1512 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  100 
 
 		 372 aa  752    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  46.5 
 
 		 485 aa  305  8.000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  44.92 
 
 		 375 aa  298  8e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  44.92 
 
 		 375 aa  298  8e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  44.92 
 
 		 375 aa  298  8e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  43.47 
 
 		 375 aa  276  5e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  44.13 
 
 		 547 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  42.78 
 
 		 375 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  44.25 
 
 		 348 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  44.25 
 
 		 348 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  42.98 
 
 		 362 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  37.09 
 
 		 461 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  36.57 
 
 		 473 aa  222  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  35.45 
 
 		 428 aa  201  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  35.09 
 
 		 387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  30.97 
 
 		 400 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  31.81 
 
 		 397 aa  169  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  36.17 
 
 		 495 aa  168  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  29.43 
 
 		 439 aa  142  6e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  33.7 
 
 		 479 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  30.61 
 
 		 366 aa  132  7.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  34.8 
 
 		 399 aa  126  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  61.63 
 
 		 416 aa  126  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  64.2 
 
 		 228 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  30.91 
 
 		 375 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  62.96 
 
 		 256 aa  117  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  65.38 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  30.69 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  64 
 
 		 192 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  29.37 
 
 		 389 aa  109  7.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  30.61 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  61.54 
 
 		 231 aa  108  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  62.34 
 
 		 444 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  60.26 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  30.77 
 
 		 412 aa  106  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  58.97 
 
 		 350 aa  106  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  59.74 
 
 		 466 aa  106  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  30.63 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  53.75 
 
 		 222 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  60 
 
 		 433 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  60 
 
 		 433 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  60 
 
 		 431 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  58.44 
 
 		 228 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  60 
 
 		 211 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  31.68 
 
 		 398 aa  103  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  57.14 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  54.67 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  53.93 
 
 		 212 aa  100  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  29.95 
 
 		 427 aa  97.4  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  30.58 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  54.55 
 
 		 682 aa  95.1  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  50.55 
 
 		 223 aa  92.4  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  60 
 
 		 106 aa  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  59.15 
 
 		 181 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  27.57 
 
 		 409 aa  90.1  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  26.92 
 
 		 406 aa  89.7  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  59.15 
 
 		 152 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  59.15 
 
 		 152 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  41.53 
 
 		 224 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  52.7 
 
 		 205 aa  87  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  55.84 
 
 		 176 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  40.5 
 
 		 111 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  51.35 
 
 		 171 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  54.05 
 
 		 170 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  53.52 
 
 		 205 aa  82.4  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  55.41 
 
 		 170 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  51.35 
 
 		 118 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  51.35 
 
 		 118 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  51.35 
 
 		 118 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  52.7 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  52.7 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  54.79 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  51.35 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  47.44 
 
 		 266 aa  78.2  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  47.89 
 
 		 1409 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  50.7 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  50.7 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  50.7 
 
 		 171 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  50 
 
 		 153 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  48.65 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  31.62 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  27.04 
 
 		 340 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  27.04 
 
 		 340 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  33.61 
 
 		 499 aa  66.6  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  29.69 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  28.11 
 
 		 451 aa  62.4  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  41.77 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  29.08 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  28.12 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  34.86 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0069  3D domain-containing protein  32.31 
 
 		 275 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  24.44 
 
 		 479 aa  57  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  36.71 
 
 		 225 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  26.32 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  41.03 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  29.52 
 
 		 266 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  32.71 
 
 		 448 aa  53.1  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  26.98 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  38.96 
 
 		 317 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1828  3D domain protein  32.14 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.937918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>