87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0982 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  100 
 
 
266 aa  533  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  38.43 
 
 
409 aa  145  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  40.17 
 
 
366 aa  142  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  38.82 
 
 
385 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  37.33 
 
 
375 aa  133  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  47.13 
 
 
436 aa  132  7.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  37.3 
 
 
479 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  34.48 
 
 
416 aa  109  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  66.25 
 
 
427 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  34.15 
 
 
387 aa  105  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  60.49 
 
 
499 aa  97.4  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  60 
 
 
439 aa  93.2  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  36.92 
 
 
399 aa  93.2  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  30.77 
 
 
461 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  30.14 
 
 
473 aa  73.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  28.82 
 
 
375 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  28.82 
 
 
375 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  28.82 
 
 
375 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  47.37 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  28.44 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  30 
 
 
375 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  45.57 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  49.33 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  53.23 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  46.75 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  28.38 
 
 
348 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  28.38 
 
 
348 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  28.63 
 
 
547 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  46.05 
 
 
118 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  45.33 
 
 
223 aa  65.1  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  46.05 
 
 
118 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  46.05 
 
 
118 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  46.05 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  50.72 
 
 
325 aa  64.3  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6585  transglycosylase domain-containing protein  50.67 
 
 
128 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  48.57 
 
 
224 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  46.67 
 
 
171 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  45.95 
 
 
111 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  46.05 
 
 
106 aa  62.4  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4245  transglycosylase-like  56.36 
 
 
126 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  45.95 
 
 
107 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  44.44 
 
 
227 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  32.12 
 
 
347 aa  60.1  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  45.83 
 
 
239 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  29.52 
 
 
372 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  42.67 
 
 
188 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  28 
 
 
362 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  41.89 
 
 
171 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  42.47 
 
 
154 aa  57  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  41.89 
 
 
171 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  41.89 
 
 
171 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  38.71 
 
 
176 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  43.06 
 
 
247 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  40 
 
 
153 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  39.24 
 
 
181 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  30.97 
 
 
170 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  41.33 
 
 
231 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  40.85 
 
 
212 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  39.24 
 
 
152 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  39.47 
 
 
192 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  39.24 
 
 
152 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  30 
 
 
343 aa  52.4  0.000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  37.84 
 
 
170 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  37.33 
 
 
328 aa  52.4  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  28.43 
 
 
400 aa  52  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  44 
 
 
211 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  29.08 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  42.11 
 
 
350 aa  51.2  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  31.01 
 
 
338 aa  50.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  27.27 
 
 
485 aa  49.7  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  25.48 
 
 
495 aa  49.3  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  34.21 
 
 
222 aa  49.3  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  38.46 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  28.5 
 
 
397 aa  47  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  37.8 
 
 
416 aa  46.2  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  20.52 
 
 
428 aa  45.8  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1828  3D domain protein  27.14 
 
 
329 aa  45.4  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.937918  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  24.03 
 
 
401 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  41.25 
 
 
466 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  24.44 
 
 
389 aa  45.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  37.62 
 
 
1409 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  25.2 
 
 
340 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  29.55 
 
 
482 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  38.46 
 
 
407 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  25.2 
 
 
340 aa  43.9  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2093  hypothetical protein  29.2 
 
 
352 aa  42.7  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00901653  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1137  Peptidase M23  27.78 
 
 
468 aa  42  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000109731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>