100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11028 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  100 
 
 
362 aa  723    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  75.62 
 
 
375 aa  537  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  75.62 
 
 
375 aa  537  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  75.62 
 
 
375 aa  537  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  73.96 
 
 
375 aa  535  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  71.19 
 
 
375 aa  519  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  63.2 
 
 
547 aa  448  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  62.97 
 
 
348 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  62.97 
 
 
348 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  42.66 
 
 
372 aa  256  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  40.22 
 
 
461 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  40.11 
 
 
485 aa  245  9e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  37.81 
 
 
473 aa  213  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  36.24 
 
 
428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  37.27 
 
 
387 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  33.03 
 
 
495 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  38.01 
 
 
366 aa  173  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  33.78 
 
 
397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  32.34 
 
 
400 aa  159  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  33.98 
 
 
375 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  34.05 
 
 
385 aa  157  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  35.71 
 
 
399 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  33.97 
 
 
479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  32.25 
 
 
409 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  56.98 
 
 
416 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  65.79 
 
 
228 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  65.38 
 
 
256 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  63.16 
 
 
228 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  60.49 
 
 
308 aa  109  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  32.72 
 
 
436 aa  109  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  67.61 
 
 
444 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  64.79 
 
 
466 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  28.48 
 
 
499 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  30.57 
 
 
427 aa  107  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  60 
 
 
350 aa  106  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  69.01 
 
 
192 aa  105  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  63.01 
 
 
211 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  64.79 
 
 
407 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  56.96 
 
 
222 aa  104  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  60.26 
 
 
274 aa  103  4e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  57.65 
 
 
231 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  61.64 
 
 
433 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  58.33 
 
 
328 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  61.64 
 
 
433 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  61.64 
 
 
431 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  66.67 
 
 
106 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  52.22 
 
 
682 aa  99.4  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  58.23 
 
 
171 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  30.79 
 
 
416 aa  96.7  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  58.33 
 
 
205 aa  96.3  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  60 
 
 
118 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  60 
 
 
118 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  60.81 
 
 
111 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  60 
 
 
118 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  33.08 
 
 
398 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  64.86 
 
 
188 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  56.41 
 
 
224 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  55.95 
 
 
205 aa  92.8  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  56.98 
 
 
170 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  58.9 
 
 
212 aa  92  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  53.26 
 
 
170 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  60 
 
 
181 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  60 
 
 
152 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  60 
 
 
152 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  32.34 
 
 
391 aa  89.4  8e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  59.46 
 
 
107 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  51.32 
 
 
223 aa  87.4  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  29.76 
 
 
412 aa  87.4  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  57.89 
 
 
176 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  56.16 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  56.76 
 
 
171 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  29.09 
 
 
401 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  56.76 
 
 
171 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  56.76 
 
 
171 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  58.11 
 
 
153 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  55.07 
 
 
1409 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  46.84 
 
 
439 aa  79.3  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  30.38 
 
 
451 aa  73.6  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  25.09 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  27.11 
 
 
389 aa  68.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  43.18 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  48.57 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  39.51 
 
 
266 aa  65.1  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  42.86 
 
 
239 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  45.71 
 
 
325 aa  60.8  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  24.01 
 
 
460 aa  60.1  0.00000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  31.82 
 
 
343 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0070  3D domain-containing protein  31.03 
 
 
309 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  36.9 
 
 
225 aa  56.2  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  28.93 
 
 
266 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  21.43 
 
 
473 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  22.34 
 
 
479 aa  55.5  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  27.78 
 
 
340 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  27.78 
 
 
340 aa  53.5  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  28.9 
 
 
295 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  40.79 
 
 
317 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  31.18 
 
 
347 aa  50.1  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  27.68 
 
 
342 aa  48.1  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  27.32 
 
 
338 aa  43.1  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  25.2 
 
 
389 aa  42.7  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>