100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0177 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  100 
 
 
409 aa  818    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  41.55 
 
 
385 aa  263  6e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  42.77 
 
 
366 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  40.21 
 
 
375 aa  243  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  37.1 
 
 
436 aa  195  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  37.82 
 
 
479 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  34.5 
 
 
387 aa  176  9e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  37.46 
 
 
416 aa  173  5.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  32.25 
 
 
439 aa  172  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  32.17 
 
 
473 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  36.48 
 
 
427 aa  171  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  37.13 
 
 
399 aa  170  4e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  30.91 
 
 
397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  32.79 
 
 
461 aa  158  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  33.6 
 
 
547 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  30.63 
 
 
499 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  34.22 
 
 
428 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  31.82 
 
 
348 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  31.82 
 
 
348 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  36.19 
 
 
398 aa  139  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  38.43 
 
 
266 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  27.2 
 
 
400 aa  137  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  32.25 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  32.25 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  32.25 
 
 
375 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  28.37 
 
 
401 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  29.16 
 
 
375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  29.46 
 
 
375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  32.76 
 
 
362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  31.38 
 
 
412 aa  124  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  29.7 
 
 
495 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  33.22 
 
 
451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  26.12 
 
 
406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  29.96 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  30.34 
 
 
460 aa  110  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  32.05 
 
 
485 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  32.2 
 
 
391 aa  107  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  29.7 
 
 
479 aa  96.3  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  27.5 
 
 
372 aa  92.8  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  29.22 
 
 
416 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  33.33 
 
 
340 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  25.09 
 
 
342 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  35.04 
 
 
359 aa  75.1  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  28.06 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0170  3D domain protein  30.22 
 
 
356 aa  72  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  30.32 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0069  3D domain-containing protein  31.01 
 
 
275 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  30.85 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  29.69 
 
 
347 aa  70.9  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  27.49 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0051  hypothetical protein  22.62 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000984601  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  40.86 
 
 
205 aa  67  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  29.58 
 
 
473 aa  66.6  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  49.32 
 
 
266 aa  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  41.38 
 
 
223 aa  65.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  51.56 
 
 
317 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  30.63 
 
 
448 aa  63.9  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2093  hypothetical protein  22.97 
 
 
352 aa  63.9  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00901653  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  40.43 
 
 
224 aa  63.2  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  26.12 
 
 
389 aa  63.2  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  43.21 
 
 
106 aa  60.8  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  47.76 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  47.95 
 
 
188 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0355  G5 domain protein  26.86 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  40.7 
 
 
118 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  40.7 
 
 
118 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  41.03 
 
 
111 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  42.31 
 
 
171 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  40.7 
 
 
118 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  45.33 
 
 
227 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  38.2 
 
 
171 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  38.2 
 
 
171 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  38.2 
 
 
171 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  43.84 
 
 
225 aa  57.4  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  43.02 
 
 
107 aa  57.4  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  40 
 
 
153 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  34.51 
 
 
205 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4245  transglycosylase-like  45.71 
 
 
126 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6585  transglycosylase domain-containing protein  50 
 
 
128 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0989  hypothetical protein  31.53 
 
 
331 aa  53.5  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  44.12 
 
 
224 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  37.5 
 
 
170 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  40.58 
 
 
212 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  37.5 
 
 
170 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0070  3D domain-containing protein  25.93 
 
 
309 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  36.36 
 
 
181 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  34.38 
 
 
154 aa  50.8  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  36.36 
 
 
152 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  36.36 
 
 
152 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1485  hypothetical protein  26.87 
 
 
337 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0902184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1755  3D/G5 domain-containing protein  26.37 
 
 
337 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0155865  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0050  hypothetical protein  29.8 
 
 
322 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000119659 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  38.57 
 
 
239 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  44.59 
 
 
176 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  38.57 
 
 
247 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  36.99 
 
 
231 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  40 
 
 
350 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1828  3D domain protein  30.91 
 
 
329 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.937918  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  28.03 
 
 
468 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  32.61 
 
 
476 aa  43.5  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>