157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0215 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  100 
 
 		 227 aa  450  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  66.37 
 
 		 225 aa  269  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  43.06 
 
 		 266 aa  144  9e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  42.62 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  68.57 
 
 		 325 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  37.44 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  37.57 
 
 		 317 aa  105  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  58.9 
 
 		 439 aa  91.3  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  59.46 
 
 		 479 aa  91.3  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  43.7 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  41.82 
 
 		 205 aa  88.6  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  47.47 
 
 		 107 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  40.15 
 
 		 223 aa  85.9  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  35.96 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  41.22 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  47.06 
 
 		 152 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  47.06 
 
 		 152 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  36.89 
 
 		 461 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  48 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  48 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  48 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  52 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  47.5 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  44.8 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  42.59 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  41.49 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  49.35 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  52.7 
 
 		 499 aa  75.9  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  52.05 
 
 		 385 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  38.94 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  50 
 
 		 171 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  49.33 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  38.05 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  45.83 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  45.83 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  45.83 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  43.59 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  40.38 
 
 		 153 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  36.94 
 
 		 176 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  42.68 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  43.27 
 
 		 106 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2988  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.88 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.382188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  43.68 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  43.68 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  43.68 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  47.22 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  41.67 
 
 		 433 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  41.77 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  41.67 
 
 		 433 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  41.67 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  37.17 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  31.71 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  43.68 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  46.67 
 
 		 436 aa  66.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  43.33 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  44.44 
 
 		 348 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  44.44 
 
 		 348 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  44.23 
 
 		 375 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  43.42 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  44.44 
 
 		 547 aa  65.1  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  37.9 
 
 		 366 aa  65.1  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0037  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  54.9 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  36.97 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  41.57 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  44.44 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  38.1 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  39.74 
 
 		 375 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  41.03 
 
 		 485 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2508  peptidoglycan binding domain-containing protein  28.4 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0275667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  43.24 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2356  glycoside hydrolase family 25  50 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000423175  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  44 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  34.69 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  41.77 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2464  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50.94 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000202368  normal  0.0272444 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  45.33 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2153  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.1 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000738312  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  39.24 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  63.89 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  44.44 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  43.48 
 
 		 1409 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0730  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.94 
 
 		 1089 aa  55.8  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18550  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18610  YD repeat protein  48 
 
 		 2277 aa  55.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  39.73 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  58.33 
 
 		 495 aa  55.5  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3347  peptidoglycan binding domain-containing protein  46.43 
 
 		 629 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  50.98 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6585  transglycosylase domain-containing protein  40.37 
 
 		 128 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0968  stage II sporulation D domain-containing protein  44.23 
 
 		 462 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00176967  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4245  transglycosylase-like  38.79 
 
 		 126 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1726  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  38.57 
 
 		 224 aa  52.4  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0528889  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  46.55 
 
 		 400 aa  52  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5192  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.98 
 
 		 322 aa  52  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000000016794  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03060  Spore cortex-lytic enzyme SleB  47.17 
 
 		 239 aa  51.6  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  42.65 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2969  peptidoglycan binding domain-containing protein  40.38 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0945  peptidoglycan-binding domain 1 protein  51.06 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.572838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  48.08 
 
 		 391 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  44.83 
 
 		 397 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>