104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30310 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  100 
 
 		 499 aa  971    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  45.71 
 
 		 439 aa  332  1e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  39.03 
 
 		 479 aa  230  4e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  40.13 
 
 		 436 aa  227  4e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  38.05 
 
 		 451 aa  196  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  34.27 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  56.1 
 
 		 427 aa  180  7e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  32.55 
 
 		 375 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  47.06 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  30.55 
 
 		 387 aa  143  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  29.05 
 
 		 409 aa  141  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  27.89 
 
 		 372 aa  129  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  44.5 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  29.87 
 
 		 375 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  28.77 
 
 		 397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  26.14 
 
 		 400 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  29.22 
 
 		 375 aa  100  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  59.14 
 
 		 266 aa  99  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  31.44 
 
 		 412 aa  95.5  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  42.11 
 
 		 461 aa  93.2  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  26.7 
 
 		 362 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  56.25 
 
 		 266 aa  90.5  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  50 
 
 		 223 aa  90.1  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  27.46 
 
 		 547 aa  90.1  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  26.64 
 
 		 348 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  26.64 
 
 		 348 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  29.12 
 
 		 495 aa  89.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  31.31 
 
 		 391 aa  83.2  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  43.41 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  48.15 
 
 		 485 aa  79.7  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  52.5 
 
 		 205 aa  79.7  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  50.67 
 
 		 231 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  48.78 
 
 		 473 aa  79.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  31.03 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  31.03 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  31.03 
 
 		 375 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  33.92 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  50.62 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  52.17 
 
 		 212 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  28.16 
 
 		 448 aa  75.5  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  48.15 
 
 		 225 aa  75.1  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  51.39 
 
 		 111 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  26.51 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  50.68 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  49.4 
 
 		 118 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  49.4 
 
 		 118 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  49.4 
 
 		 118 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  51.39 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  30.05 
 
 		 406 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  47.22 
 
 		 205 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  47.78 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  30.68 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  48.05 
 
 		 239 aa  70.1  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  44 
 
 		 107 aa  69.3  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  30.94 
 
 		 401 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  47.22 
 
 		 188 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  44.09 
 
 		 228 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  46.75 
 
 		 247 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  26.74 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  50.7 
 
 		 154 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  46.84 
 
 		 350 aa  68.6  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  40.4 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  49.32 
 
 		 106 aa  67  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  38.94 
 
 		 176 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  28.42 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  47.83 
 
 		 181 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  44.44 
 
 		 170 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  44.12 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  44.44 
 
 		 170 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  35.1 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  47.83 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  47.83 
 
 		 152 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  46.84 
 
 		 308 aa  62.8  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  42.86 
 
 		 317 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  44.44 
 
 		 153 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  47.83 
 
 		 171 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  47.83 
 
 		 171 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  47.83 
 
 		 171 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  42.86 
 
 		 222 aa  60.1  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6585  transglycosylase domain-containing protein  40.91 
 
 		 128 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  46.38 
 
 		 256 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  46.05 
 
 		 211 aa  58.9  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  42.11 
 
 		 444 aa  56.6  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4245  transglycosylase-like  38.82 
 
 		 126 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  42.11 
 
 		 433 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  42.11 
 
 		 433 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  42.11 
 
 		 431 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  40.51 
 
 		 274 aa  54.3  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  39.47 
 
 		 328 aa  54.3  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  42.11 
 
 		 466 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  23.31 
 
 		 340 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  41.03 
 
 		 192 aa  52.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1485  hypothetical protein  29.13 
 
 		 337 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0902184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1755  3D/G5 domain-containing protein  28.16 
 
 		 337 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0155865  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  33.33 
 
 		 682 aa  50.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  21.8 
 
 		 340 aa  50.1  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  30.93 
 
 		 343 aa  50.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  44.44 
 
 		 1409 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  40.79 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  38.46 
 
 		 228 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>