109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4559 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  100 
 
 		 495 aa  954    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  48.16 
 
 		 428 aa  331  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  37.05 
 
 		 397 aa  196  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  32.62 
 
 		 461 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  32.45 
 
 		 473 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  33.86 
 
 		 375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  33.86 
 
 		 375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  33.86 
 
 		 375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  36.7 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  36.64 
 
 		 400 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  32.49 
 
 		 375 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  32.36 
 
 		 547 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  31.91 
 
 		 375 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  32.72 
 
 		 485 aa  167  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  54.44 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  35.26 
 
 		 362 aa  159  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  34.14 
 
 		 348 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  34.14 
 
 		 348 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  33.04 
 
 		 385 aa  144  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  31.86 
 
 		 366 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  29.61 
 
 		 479 aa  127  5e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  29.87 
 
 		 387 aa  126  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  35.37 
 
 		 416 aa  121  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  38.82 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  69.33 
 
 		 256 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  68.42 
 
 		 228 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  65.28 
 
 		 444 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  29.75 
 
 		 499 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  63.01 
 
 		 222 aa  103  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  60.27 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  36.27 
 
 		 375 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  61.11 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  57.89 
 
 		 228 aa  101  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  30.5 
 
 		 401 aa  99.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  30.79 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  58.33 
 
 		 433 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  58.33 
 
 		 433 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  58.33 
 
 		 431 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  61.64 
 
 		 192 aa  97.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  33.44 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  62.16 
 
 		 328 aa  96.3  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  59.21 
 
 		 188 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  55.56 
 
 		 211 aa  94.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  55.43 
 
 		 118 aa  94  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  55.43 
 
 		 118 aa  94  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  55.43 
 
 		 118 aa  94  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  28.24 
 
 		 439 aa  93.2  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  28.35 
 
 		 406 aa  92.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  56.58 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  57.53 
 
 		 205 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  58.67 
 
 		 111 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  56.58 
 
 		 308 aa  90.1  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  54.55 
 
 		 224 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  53.41 
 
 		 205 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  29.67 
 
 		 451 aa  89  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  56.58 
 
 		 274 aa  88.2  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  52.13 
 
 		 106 aa  88.6  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  57.33 
 
 		 171 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  57.33 
 
 		 171 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  56.41 
 
 		 170 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  57.33 
 
 		 171 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  58.11 
 
 		 171 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  53.33 
 
 		 107 aa  87.4  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  54.67 
 
 		 170 aa  87  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  54.67 
 
 		 181 aa  87  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  43.93 
 
 		 682 aa  86.7  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  54.67 
 
 		 152 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  54.67 
 
 		 152 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  34.2 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  54.05 
 
 		 1409 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  55.7 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  27.07 
 
 		 343 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  56.34 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  51.72 
 
 		 153 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  23.63 
 
 		 389 aa  79.7  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  52.44 
 
 		 212 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  27.18 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  30.35 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  27.54 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  37 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  41.75 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  51.43 
 
 		 154 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  43.42 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  29.85 
 
 		 338 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  35.26 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  25.79 
 
 		 473 aa  67  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  49.23 
 
 		 247 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  46.48 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  30.51 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  41.86 
 
 		 223 aa  65.1  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  27.6 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  29.16 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0051  hypothetical protein  27.27 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000984601  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  39.24 
 
 		 239 aa  57  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  58.33 
 
 		 227 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  39.47 
 
 		 225 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  23.39 
 
 		 479 aa  54.3  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1755  3D/G5 domain-containing protein  31.37 
 
 		 337 aa  53.9  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0155865  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  32.08 
 
 		 359 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  25.51 
 
 		 266 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>