110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0588 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  100 
 
 		 375 aa  757    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  44.99 
 
 		 385 aa  276  5e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  41.47 
 
 		 409 aa  247  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  38.78 
 
 		 366 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  39.34 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  38.38 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  39.33 
 
 		 479 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  36.53 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  31.89 
 
 		 439 aa  182  8.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  37.28 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  31.95 
 
 		 499 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  34.44 
 
 		 473 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  38.78 
 
 		 399 aa  170  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  34.77 
 
 		 461 aa  170  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  32.31 
 
 		 547 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  32.71 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  32.71 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  32.71 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  31.68 
 
 		 375 aa  155  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  31.99 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  31.99 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  33.05 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  30.85 
 
 		 375 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  33.42 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  32.35 
 
 		 400 aa  145  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  38.67 
 
 		 266 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  32.61 
 
 		 397 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  36.03 
 
 		 398 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  31.37 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  31.85 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  30 
 
 		 485 aa  121  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  28.51 
 
 		 495 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  29.86 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  29.67 
 
 		 389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  31.8 
 
 		 391 aa  106  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  31.97 
 
 		 416 aa  94  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  24.55 
 
 		 460 aa  90.1  6e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  26.22 
 
 		 479 aa  86.7  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  27.51 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  52.05 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  54.79 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  25.17 
 
 		 406 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  57.14 
 
 		 325 aa  77.4  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  42.45 
 
 		 107 aa  76.6  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  44.76 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  43.68 
 
 		 205 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  47.95 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  40.57 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  41.03 
 
 		 350 aa  72.8  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  25.36 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  38.89 
 
 		 171 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  38.89 
 
 		 171 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  38.89 
 
 		 171 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  50 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  47.56 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  23.96 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  37.74 
 
 		 154 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  46.25 
 
 		 205 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  24.91 
 
 		 347 aa  69.3  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  45.21 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  39.09 
 
 		 111 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  47.3 
 
 		 188 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  46.75 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  38.32 
 
 		 118 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  38.32 
 
 		 118 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  38.32 
 
 		 118 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  38.39 
 
 		 170 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4245  transglycosylase-like  46.75 
 
 		 126 aa  63.9  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.91543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  43.9 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  39.81 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  29.1 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  46.58 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6585  transglycosylase domain-containing protein  50 
 
 		 128 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  24.62 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  26.26 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  45.71 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  46.38 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  49.35 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0170  3D domain protein  27.86 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  36.94 
 
 		 239 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  43.9 
 
 		 181 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  43.9 
 
 		 152 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  43.9 
 
 		 152 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0070  3D domain-containing protein  28.46 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  34.23 
 
 		 247 aa  57  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  47.37 
 
 		 211 aa  57  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  44.21 
 
 		 1409 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  44.74 
 
 		 407 aa  56.2  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2093  hypothetical protein  26.87 
 
 		 352 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00901653  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  30.47 
 
 		 359 aa  54.7  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  22.34 
 
 		 473 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  42.86 
 
 		 466 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  42.86 
 
 		 222 aa  52.8  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  40.91 
 
 		 228 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  32.61 
 
 		 338 aa  50.8  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  41.33 
 
 		 228 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  42.67 
 
 		 308 aa  50.4  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  38.16 
 
 		 328 aa  50.1  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1828  3D domain protein  25.74 
 
 		 329 aa  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.937918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  41.98 
 
 		 433 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.135951 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>