84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2938 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2908  transglycosylase-like protein  100 
 
 
181 aa  305  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2952  transglycosylase domain-containing protein  100 
 
 
152 aa  304  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2938  transglycosylase domain-containing protein  100 
 
 
152 aa  304  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.193282  normal  0.149683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2620  transglycosylase domain-containing protein  51.61 
 
 
170 aa  140  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.516497  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4506  transglycosylase domain-containing protein  48.57 
 
 
153 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3961  transglycosylase domain-containing protein  49.68 
 
 
170 aa  135  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3568  transglycosylase domain-containing protein  43.31 
 
 
171 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3563  transglycosylase-like protein  43.31 
 
 
171 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0104919  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3636  transglycosylase domain-containing protein  43.31 
 
 
171 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205646  normal  0.539069 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3962  transglycosylase domain-containing protein  59.62 
 
 
111 aa  123  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3564  transglycosylase-like protein  61 
 
 
118 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0268066  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3569  transglycosylase domain-containing protein  61 
 
 
118 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34180  transglycosylase family protein  62.5 
 
 
205 aa  122  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.351272  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3637  transglycosylase domain-containing protein  61 
 
 
118 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132373  normal  0.712859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3031  Transglycosylase domain protein  58.59 
 
 
107 aa  120  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0469  Transglycosylase domain protein  55.24 
 
 
224 aa  120  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3365  Transglycosylase domain protein  57.28 
 
 
106 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.154336  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11912  resuscitation-promoting factor rpfC  58.25 
 
 
176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5276  Transglycosylase domain protein  58.33 
 
 
205 aa  115  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2619  transglycosylase domain-containing protein  68.42 
 
 
171 aa  115  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683498  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0996  Transglycosylase domain protein  59.14 
 
 
212 aa  112  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12476  resuscitation-promoting factor rpfE  72.22 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.411212 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12414  resuscitation-promoting factor rpfD  54.26 
 
 
154 aa  105  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.03818e-19  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02640  transglycosylase-like protein  50.47 
 
 
350 aa  103  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1231  Transglycosylase domain protein  57.58 
 
 
211 aa  103  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4566  transglycosylase domain-containing protein  54.08 
 
 
433 aa  103  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4479  transglycosylase-like protein  54.08 
 
 
433 aa  103  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4862  transglycosylase domain-containing protein  54.08 
 
 
431 aa  103  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.110763 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0905  transglycosylase domain-containing protein  63.51 
 
 
231 aa  102  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.17882  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1956  Transglycosylase domain protein  61.9 
 
 
192 aa  99.8  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1703  transglycosylase domain-containing protein  56.98 
 
 
466 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10884  resuscitation-promoting factor rpfA  54.08 
 
 
407 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000869072  normal  0.154572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5049  FHA domain-containing protein  56.98 
 
 
444 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0821  Transglycosylase domain protein  57.53 
 
 
222 aa  95.9  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.137438  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  51.06 
 
 
387 aa  94.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22420  transglycosylase-like protein  48.54 
 
 
328 aa  93.6  8e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0419592  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  63.89 
 
 
348 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  63.89 
 
 
547 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  63.89 
 
 
348 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  59.15 
 
 
485 aa  93.6  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11028  resuscitation-promoting factor rpfB  60 
 
 
362 aa  90.5  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.820397 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4940  Transglycosylase domain protein  53.41 
 
 
682 aa  90.1  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5954  Transglycosylase domain protein  57.14 
 
 
228 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139784  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  59.15 
 
 
372 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4170  Transglycosylase domain protein  59.72 
 
 
228 aa  89  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2328  Transglycosylase domain protein  63.24 
 
 
256 aa  89.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483486  hitchhiker  0.000113604 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23910  hypothetical protein  59.15 
 
 
416 aa  89.4  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.058422  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14360  Rpf resuscitation promoting factor with transglycosylase-like domain  46.99 
 
 
223 aa  89  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  50.55 
 
 
461 aa  89  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03870  transglycosylase family protein  56.41 
 
 
274 aa  88.2  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0402791 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  57.75 
 
 
375 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  57.75 
 
 
375 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  57.75 
 
 
375 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  55 
 
 
375 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  56.34 
 
 
375 aa  86.3  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  54.67 
 
 
495 aa  85.1  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  54.55 
 
 
428 aa  84.3  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03860  transglycosylase-like protein  55.41 
 
 
308 aa  84  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  54.17 
 
 
473 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0215  transglycosylase domain-containing protein  47.06 
 
 
227 aa  80.1  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.324911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1457  TP901 family phage tail tape measure protein  47.87 
 
 
1409 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.143459  normal  0.730205 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  52.78 
 
 
400 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  52.78 
 
 
397 aa  73.6  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1153  transglycosylase domain-containing protein  43.56 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.478792 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  50 
 
 
479 aa  67.8  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4365  transglycosylase-like  39.29 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.684543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0213  transglycosylase domain-containing protein  38.71 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0183  Transglycosylase domain protein  46.97 
 
 
325 aa  65.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.831864  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  41.77 
 
 
436 aa  64.3  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  47.83 
 
 
499 aa  63.9  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  45.71 
 
 
439 aa  62.8  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  45.83 
 
 
385 aa  60.8  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5145  Transglycosylase domain protein  41.33 
 
 
317 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4366  transglycosylase-like  38.89 
 
 
239 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.498193  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  43.48 
 
 
427 aa  53.9  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4557  Transglycosylase domain protein  39.51 
 
 
399 aa  53.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  38.55 
 
 
366 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  39.24 
 
 
266 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  36.36 
 
 
409 aa  50.4  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  43.48 
 
 
416 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  40.24 
 
 
375 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4565  Transglycosylase domain protein  36.76 
 
 
224 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.651995  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2170  transglycosylase domain-containing protein  39.18 
 
 
231 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0606274  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2132  transglycosylase domain-containing protein  39.18 
 
 
231 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00807725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>