65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1954 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  100 
 
 		 448 aa  895    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  32.83 
 
 		 389 aa  178  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  32.94 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  57.8 
 
 		 412 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  58.1 
 
 		 359 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  52.29 
 
 		 398 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  27.13 
 
 		 460 aa  130  7.000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  58.1 
 
 		 467 aa  129  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  59.3 
 
 		 391 aa  122  9e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1108  secreted protein  55.21 
 
 		 249 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673258  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0104  secreted protein  55.67 
 
 		 239 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8519  hypothetical protein  46.15 
 
 		 234 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12044  normal  0.728099 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1077  hypothetical protein  49.55 
 
 		 272 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  55.34 
 
 		 231 aa  116  7.999999999999999e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6520  hypothetical protein  51.04 
 
 		 164 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  51.55 
 
 		 209 aa  114  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1880  secreted protein  44.38 
 
 		 196 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3088  hypothetical protein  51.35 
 
 		 238 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.696297 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0802  hypothetical protein  51.46 
 
 		 243 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0458  secreted protein  51.04 
 
 		 216 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466992  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0653  hypothetical protein  55.29 
 
 		 258 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2063  membrane-bound transglycosylase  49.04 
 
 		 445 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000226542 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3832  hypothetical protein  53.12 
 
 		 263 aa  106  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2200  hypothetical protein  44.44 
 
 		 145 aa  103  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130764  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1058  secreted protein  47.92 
 
 		 222 aa  103  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0815  hypothetical protein  45.22 
 
 		 225 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0733  hypothetical protein  44.86 
 
 		 220 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0832  Transglycosylase domain protein  46.08 
 
 		 280 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463416 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0869  hypothetical protein  44.64 
 
 		 232 aa  97.8  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.494437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0730  hypothetical protein  46.39 
 
 		 348 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  48.84 
 
 		 479 aa  93.2  9e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0734  hypothetical protein  45.83 
 
 		 227 aa  91.3  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0989  hypothetical protein  43.88 
 
 		 331 aa  87.4  4e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30310  hypothetical protein  29.53 
 
 		 499 aa  77  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.750853  normal  0.244696 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  36.63 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0355  G5 domain protein  42.27 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1953  Transglycosylase domain protein  33.85 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.232076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2155  hypothetical protein  38.54 
 
 		 282 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.36389  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  33.12 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  31.32 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  33.15 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0139  hypothetical protein  40.48 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  34.55 
 
 		 1995 aa  56.6  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2727  Transglycosylase domain protein  34.39 
 
 		 427 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.986805  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  28.04 
 
 		 461 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2728  Transglycosylase domain protein  31.85 
 
 		 416 aa  54.3  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456826  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  32.71 
 
 		 372 aa  53.5  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  28.07 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  27.96 
 
 		 387 aa  52.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  33.33 
 
 		 343 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  39.51 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  29.38 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  36.27 
 
 		 347 aa  48.5  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  29.38 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  29.38 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  29.44 
 
 		 375 aa  47  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1758  transglycosylase domain-containing protein  30.43 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1712  transglycosylase-like protein  30.43 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  26.98 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  28 
 
 		 547 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  32.53 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  29.24 
 
 		 495 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  26.45 
 
 		 401 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  27.4 
 
 		 389 aa  43.9  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  27.31 
 
 		 428 aa  43.1  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>