39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0832 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0832  Transglycosylase domain protein  100 
 
 
280 aa  550  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000463416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0730  hypothetical protein  75 
 
 
348 aa  162  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  58.54 
 
 
467 aa  115  6e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  50.98 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  46.4 
 
 
231 aa  110  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  49 
 
 
412 aa  109  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1077  hypothetical protein  44.17 
 
 
272 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3832  hypothetical protein  57.89 
 
 
263 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0733  hypothetical protein  48.91 
 
 
220 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  46.08 
 
 
448 aa  105  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  52.44 
 
 
391 aa  105  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0458  secreted protein  51.04 
 
 
216 aa  104  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466992  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0815  hypothetical protein  51.69 
 
 
225 aa  104  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3088  hypothetical protein  51.43 
 
 
238 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.696297 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0104  secreted protein  55.84 
 
 
239 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2200  hypothetical protein  53.09 
 
 
145 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130764  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  46 
 
 
398 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6520  hypothetical protein  47.25 
 
 
164 aa  99.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0869  hypothetical protein  49.44 
 
 
232 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.494437  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8519  hypothetical protein  44.55 
 
 
234 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12044  normal  0.728099 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  49.38 
 
 
451 aa  97.8  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0734  hypothetical protein  49.44 
 
 
227 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  48.78 
 
 
359 aa  97.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  51.95 
 
 
209 aa  96.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2063  membrane-bound transglycosylase  53.09 
 
 
445 aa  95.9  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000226542 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1880  secreted protein  38.35 
 
 
196 aa  94.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1108  secreted protein  46.34 
 
 
249 aa  93.2  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673258  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1058  secreted protein  45.83 
 
 
222 aa  92.8  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0653  hypothetical protein  47.56 
 
 
258 aa  89.7  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0989  hypothetical protein  50 
 
 
331 aa  88.2  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0802  hypothetical protein  43 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  49.35 
 
 
479 aa  82  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  29.85 
 
 
460 aa  74.7  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0355  G5 domain protein  50.68 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0139  hypothetical protein  42.05 
 
 
194 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2155  hypothetical protein  42.68 
 
 
282 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.36389  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1742  hypothetical protein  30.17 
 
 
222 aa  48.5  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.903538  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  34.21 
 
 
2179 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  36.11 
 
 
2272 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>