22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1742 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1742  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  446  1.0000000000000001e-124  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.903538  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0593  hypothetical protein  58.23 
 
 
127 aa  85.9  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000883675  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1867  aggregation promoting factor-like surface protein  52.78 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1547  aggregation promoting factor-like surface protein  33.87 
 
 
261 aa  56.2  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0149607  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1982  LysM domain-containing protein  33.61 
 
 
184 aa  56.6  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1546  aggregation promoting factor-like surface protein  36.54 
 
 
307 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000247102  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0415  peptidoglycan-binding LysM  47.83 
 
 
203 aa  53.1  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00826728  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1077  hypothetical protein  44 
 
 
272 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0696  aggregation promoting factor-like surface protein  42.47 
 
 
164 aa  47  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000939064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0733  hypothetical protein  42.67 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0730  hypothetical protein  36.84 
 
 
348 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2148  LysM domain-containing protein  33.33 
 
 
179 aa  45.4  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.321456  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1314  peptidoglycan-binding LysM  36.62 
 
 
253 aa  44.3  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1529  hypothetical protein  27.59 
 
 
137 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.210241 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0355  G5 domain protein  41.43 
 
 
328 aa  43.9  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0438  SH3 type 3 domain protein  36.84 
 
 
289 aa  43.5  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  41.33 
 
 
467 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1312  peptidoglycan-binding LysM  36.62 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  38.27 
 
 
451 aa  43.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  43.42 
 
 
209 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0832  Transglycosylase domain protein  36.84 
 
 
280 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000463416 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  34.18 
 
 
460 aa  42.4  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>