57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0355 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0355  G5 domain protein  100 
 
 		 328 aa  672    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0989  hypothetical protein  55.09 
 
 		 331 aa  342  5.999999999999999e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  32.82 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  34.1 
 
 		 398 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  34.71 
 
 		 391 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  31.9 
 
 		 412 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  31.29 
 
 		 451 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1077  hypothetical protein  53.54 
 
 		 272 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  36.69 
 
 		 359 aa  94  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  51.19 
 
 		 231 aa  90.5  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  46.08 
 
 		 467 aa  89.4  9e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0730  hypothetical protein  53.75 
 
 		 348 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0734  hypothetical protein  58.46 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0458  secreted protein  44.79 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466992  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2063  membrane-bound transglycosylase  43.56 
 
 		 445 aa  79.7  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000226542 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0869  hypothetical protein  46.34 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.494437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1108  secreted protein  49.37 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673258  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0733  hypothetical protein  46.07 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1058  secreted protein  42.31 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8519  hypothetical protein  60.32 
 
 		 234 aa  75.5  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12044  normal  0.728099 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  42.27 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3088  hypothetical protein  57.58 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.696297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6520  hypothetical protein  45.24 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0802  hypothetical protein  44.55 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2200  hypothetical protein  46.25 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130764  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  43.59 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0104  secreted protein  44.58 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0832  Transglycosylase domain protein  46.91 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  43.37 
 
 		 209 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3832  hypothetical protein  44.71 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1880  secreted protein  44.19 
 
 		 196 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0815  hypothetical protein  45.33 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0653  hypothetical protein  43.37 
 
 		 258 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  25.33 
 
 		 340 aa  63.9  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  24.89 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  27.27 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  26.72 
 
 		 406 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  38.46 
 
 		 479 aa  53.1  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0069  3D domain-containing protein  28.15 
 
 		 275 aa  53.1  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  28.39 
 
 		 401 aa  52.8  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  29.66 
 
 		 347 aa  51.2  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  27.2 
 
 		 295 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  24.62 
 
 		 338 aa  50.8  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1485  hypothetical protein  24.9 
 
 		 337 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0902184  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1755  3D/G5 domain-containing protein  25.94 
 
 		 337 aa  49.7  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0155865  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  26.7 
 
 		 495 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  27.56 
 
 		 461 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  28.57 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  26.7 
 
 		 479 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  31.93 
 
 		 473 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  27.82 
 
 		 375 aa  47.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0070  3D domain-containing protein  22.86 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0050  hypothetical protein  23.33 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119659 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  27.43 
 
 		 473 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1742  hypothetical protein  41.43 
 
 		 222 aa  43.9  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.903538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2093  hypothetical protein  31.43 
 
 		 352 aa  43.1  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00901653  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0051  hypothetical protein  24.43 
 
 		 320 aa  42.7  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000984601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>