76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0973 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  100 
 
 
359 aa  710    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  47.87 
 
 
451 aa  236  4e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  47.92 
 
 
398 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  43.77 
 
 
389 aa  212  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  45.49 
 
 
412 aa  211  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  47.56 
 
 
391 aa  203  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  72.12 
 
 
209 aa  169  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0458  secreted protein  72.45 
 
 
216 aa  163  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466992  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  75.51 
 
 
467 aa  163  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6520  hypothetical protein  67.71 
 
 
164 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1058  secreted protein  67.96 
 
 
222 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3088  hypothetical protein  51.3 
 
 
238 aa  153  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.696297 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0104  secreted protein  65.66 
 
 
239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1108  secreted protein  68.37 
 
 
249 aa  153  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673258  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8519  hypothetical protein  57.26 
 
 
234 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12044  normal  0.728099 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0869  hypothetical protein  61.22 
 
 
232 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.494437  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  57.69 
 
 
448 aa  135  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2200  hypothetical protein  50 
 
 
145 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130764  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1077  hypothetical protein  64.21 
 
 
272 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1880  secreted protein  54.17 
 
 
196 aa  126  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0815  hypothetical protein  53.77 
 
 
225 aa  125  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0734  hypothetical protein  57.29 
 
 
227 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0733  hypothetical protein  59.14 
 
 
220 aa  119  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2063  membrane-bound transglycosylase  53.4 
 
 
445 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000226542 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  61.63 
 
 
479 aa  117  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0355  G5 domain protein  31.94 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  51.2 
 
 
231 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3832  hypothetical protein  55.56 
 
 
263 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  55.68 
 
 
460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0730  hypothetical protein  58.75 
 
 
348 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0802  hypothetical protein  52.43 
 
 
243 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0653  hypothetical protein  57.65 
 
 
258 aa  110  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0989  hypothetical protein  30.8 
 
 
331 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0832  Transglycosylase domain protein  48.78 
 
 
280 aa  99.4  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000463416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2155  hypothetical protein  55 
 
 
282 aa  93.6  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.36389  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  35.97 
 
 
409 aa  86.7  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0139  hypothetical protein  51.25 
 
 
194 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  37.41 
 
 
295 aa  82.4  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0051  hypothetical protein  32.59 
 
 
320 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000984601  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0588  Transglycosylase domain protein  31.54 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  31.34 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  31.34 
 
 
340 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0170  3D domain protein  29.5 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  31.32 
 
 
366 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  31.06 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  32.18 
 
 
397 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1044  Transglycosylase domain protein  36.92 
 
 
385 aa  63.5  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0594679  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3857  transglycosylase domain-containing protein  37.7 
 
 
387 aa  63.2  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.436171  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  29.41 
 
 
401 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0070  3D domain-containing protein  32.14 
 
 
309 aa  61.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  34.35 
 
 
400 aa  60.1  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  32.14 
 
 
338 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  32.87 
 
 
473 aa  57  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4559  Transglycosylase domain protein  31.87 
 
 
495 aa  56.2  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2093  hypothetical protein  28.78 
 
 
352 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00901653  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  37.93 
 
 
1995 aa  55.8  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  23.68 
 
 
342 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  28.28 
 
 
389 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1512  Transglycosylase domain protein  30.21 
 
 
372 aa  53.9  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.658978  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0974  Transglycosylase domain protein  32.43 
 
 
479 aa  52.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564871  normal  0.0145438 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2422  peptidase M23B  36.67 
 
 
475 aa  50.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638116  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  25.5 
 
 
473 aa  50.1  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3233  Transglycosylase domain protein  34.92 
 
 
485 aa  50.1  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  28.28 
 
 
347 aa  50.1  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4264  transglycosylase-like protein  31.47 
 
 
375 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4350  transglycosylase domain-containing protein  31.47 
 
 
375 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0290151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4643  transglycosylase domain-containing protein  31.47 
 
 
375 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0389422  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4558  Transglycosylase domain protein  33.33 
 
 
428 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0050  hypothetical protein  27.65 
 
 
322 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000119659 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  34.18 
 
 
452 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32470  hypothetical protein  32.5 
 
 
461 aa  47  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.826971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1932  transglycosylase domain-containing protein  30.77 
 
 
375 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0231003  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4801  transglycosylase domain-containing protein  30.29 
 
 
375 aa  46.2  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0853  Transglycosylase domain protein  35.1 
 
 
436 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1689  transglycosylase domain-containing protein  26.67 
 
 
547 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0793761  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0982  Transglycosylase domain protein  25.81 
 
 
266 aa  43.5  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>