146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2093 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2093  hypothetical protein  100 
 
 
352 aa  698    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00901653  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0170  3D domain protein  49.84 
 
 
356 aa  321  9.000000000000001e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0068  3D domain-containing protein  43.15 
 
 
343 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0535  3D domain protein  42.31 
 
 
342 aa  251  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418011  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2842  3D/G5 domain-containing protein  35.39 
 
 
340 aa  209  8e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2528  3D/G5 domain-containing protein  35.26 
 
 
340 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0109  3D domain protein  33.89 
 
 
473 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472603  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0051  hypothetical protein  37.94 
 
 
295 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000966472 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2112  3D domain protein  39.21 
 
 
347 aa  189  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.300796  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0044  3D domain-containing protein  33.54 
 
 
338 aa  169  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.991775  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0033  3D domain protein  33.13 
 
 
401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0051  hypothetical protein  33.33 
 
 
320 aa  162  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000984601  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0035  3D domain protein  32.63 
 
 
406 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.686039  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0070  3D domain-containing protein  34.92 
 
 
309 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0050  hypothetical protein  33.82 
 
 
322 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000119659 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1485  hypothetical protein  32.25 
 
 
337 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0902184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0070  3D domain protein  31.09 
 
 
389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000504342  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1755  3D/G5 domain-containing protein  32.25 
 
 
337 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0155865  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1828  3D domain protein  30.96 
 
 
329 aa  136  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.937918  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0069  3D domain-containing protein  33.21 
 
 
275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4744  3D domain-containing protein  49.07 
 
 
219 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5061  hypothetical protein  48.15 
 
 
208 aa  102  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2880  3D domain protein  51.96 
 
 
236 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3025  3D domain protein  50.98 
 
 
212 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2504  hypothetical protein  48.74 
 
 
429 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0069  3D domain protein  31.71 
 
 
282 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000398521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5156  hypothetical protein  45.45 
 
 
208 aa  92.4  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5033  hypothetical protein  45.45 
 
 
219 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3534  3D domain-containing protein  45.45 
 
 
219 aa  92.8  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5067  hypothetical protein  45.45 
 
 
208 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4793  hypothetical protein  45.45 
 
 
219 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4634  hypothetical protein  45.45 
 
 
219 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4654  hypothetical protein  45.45 
 
 
219 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5062  3D domain protein  45.45 
 
 
206 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0180  hypothetical protein  44.44 
 
 
208 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1243  hypothetical protein  41.67 
 
 
410 aa  86.3  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.015154  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1437  3D domain-containing protein  41.67 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00168198  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0310  hypothetical protein  42.37 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0756  hypothetical protein  36.19 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.444213  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1491  3D domain protein  27.78 
 
 
285 aa  79.7  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  28.72 
 
 
389 aa  79  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1049  3D domain protein  46.73 
 
 
145 aa  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2273  enterotoxin  42.86 
 
 
500 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0333544 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5330  hypothetical protein  43.86 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3987700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2684  hypothetical protein  41.96 
 
 
524 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0188967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2756  hypothetical protein  41.96 
 
 
440 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00725843  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2705  hypothetical protein  40.52 
 
 
524 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2967  hypothetical protein  41.96 
 
 
440 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000478189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3009  enterotoxin  41.96 
 
 
548 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2968  enterotoxin  40.52 
 
 
529 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2964  enterotoxin  41.96 
 
 
488 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000376462 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3005  hypothetical protein  40.52 
 
 
570 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5090  hypothetical protein  42.98 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4920  enterotoxin/cell wall-binding protein  42.98 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4935  enterotoxin/cell wall-binding protein  42.98 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5481  hypothetical protein  42.98 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5592  hypothetical protein  42.98 
 
 
292 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165295 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5033  3D domain-containing protein  42.98 
 
 
292 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5412  hypothetical protein  42.98 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5364  hypothetical protein  42.98 
 
 
292 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2759  3D domain-containing protein  40.52 
 
 
575 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00579221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5360  hypothetical protein  42.98 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3773  3D domain-containing protein  42.98 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3481  3D domain-containing protein  31.75 
 
 
321 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00402969  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0812  hypothetical protein  41.44 
 
 
427 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.791616  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0651  hypothetical protein  41.18 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0595  hypothetical protein  41.18 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0685  hypothetical protein  41.18 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00231685  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1282  Transglycosylase domain protein  30.05 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000673899 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2393  3D domain-containing protein  40.71 
 
 
297 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3461  enterotoxin/cell-wall binding protein  38.94 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000115171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3725  hypothetical protein  38.94 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9172500000000004e-32 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0644  Transglycosylase domain protein  29.53 
 
 
473 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3815  hypothetical protein  41.35 
 
 
316 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00183753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3743  hypothetical protein  41.35 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00197762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3562  hypothetical protein  38.05 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0820775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3845  hypothetical protein  38.05 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00016497  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1487  hypothetical protein  41.35 
 
 
310 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000144613  hitchhiker  0.00534322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3766  hypothetical protein  41.35 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000229315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0716  hypothetical protein  39.25 
 
 
423 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.663265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3475  enterotoxin/cell wall-binding protein  41.35 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0617059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4620  hypothetical protein  40.54 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944224 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0740  hypothetical protein  40.57 
 
 
424 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000128558 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0752  hypothetical protein  38.74 
 
 
427 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.861863  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0596  hypothetical protein  41.75 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1212  transglycosylase domain-containing protein  30.05 
 
 
400 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0852875  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0574  3D domain-containing protein  41.75 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1770  3D domain-containing protein  43.12 
 
 
526 aa  68.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.103231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1015  fibronectin type III domain protein  40.57 
 
 
421 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000062719  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1114  3D domain protein  47.67 
 
 
1063 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  28.91 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0707  3D domain-containing protein  39.42 
 
 
478 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0177  G5 domain-containing protein  26.5 
 
 
409 aa  67.8  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.295534 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0599  3D domain-containing protein  37.84 
 
 
431 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0887  hypothetical protein  40 
 
 
420 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0905  Transglycosylase domain protein  29.69 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00644847  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0849  enterotoxin  39.42 
 
 
422 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0692  enterotoxin/cell wall-binding protein  40 
 
 
410 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1557  peptidoglycan-binding LysM  38.18 
 
 
517 aa  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4487  enterotoxin  40 
 
 
469 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000113564 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>