37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3832 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3832  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  524  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8519  hypothetical protein  39.36 
 
 
234 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12044  normal  0.728099 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3088  hypothetical protein  39.35 
 
 
238 aa  136  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.696297 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  59.05 
 
 
389 aa  130  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0458  secreted protein  60.42 
 
 
216 aa  124  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466992  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0104  secreted protein  64.37 
 
 
239 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  50.47 
 
 
412 aa  121  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2063  membrane-bound transglycosylase  57.28 
 
 
445 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000226542 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1108  secreted protein  54.17 
 
 
249 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673258  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  56.25 
 
 
467 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0733  hypothetical protein  64.47 
 
 
220 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  52.38 
 
 
398 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6520  hypothetical protein  37.43 
 
 
164 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0734  hypothetical protein  66.23 
 
 
227 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  55.56 
 
 
359 aa  112  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  56.04 
 
 
209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1880  secreted protein  65.82 
 
 
196 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  48.96 
 
 
451 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  53.12 
 
 
448 aa  109  5e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  55.81 
 
 
391 aa  109  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2200  hypothetical protein  66.23 
 
 
145 aa  109  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130764  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0815  hypothetical protein  59.49 
 
 
225 aa  109  6e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1058  secreted protein  55.56 
 
 
222 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1077  hypothetical protein  65.79 
 
 
272 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0869  hypothetical protein  52.58 
 
 
232 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.494437  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0832  Transglycosylase domain protein  57.89 
 
 
280 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000463416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0730  hypothetical protein  55.7 
 
 
348 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0653  hypothetical protein  59.21 
 
 
258 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  54.35 
 
 
231 aa  101  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0802  hypothetical protein  49.07 
 
 
243 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  51.16 
 
 
479 aa  90.5  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  49.41 
 
 
460 aa  84.3  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0989  hypothetical protein  42.35 
 
 
331 aa  77.4  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2155  hypothetical protein  48.31 
 
 
282 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.36389  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0355  G5 domain protein  44.71 
 
 
328 aa  72.4  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0139  hypothetical protein  50 
 
 
194 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  35.58 
 
 
1995 aa  52.8  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>