37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0815 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0815  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  458  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0869  hypothetical protein  75.11 
 
 
232 aa  271  5.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.494437  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0734  hypothetical protein  42.79 
 
 
227 aa  171  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  61.16 
 
 
451 aa  149  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  66.06 
 
 
398 aa  147  9e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  74.71 
 
 
391 aa  145  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0733  hypothetical protein  58.33 
 
 
220 aa  143  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3088  hypothetical protein  51.25 
 
 
238 aa  142  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.696297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8519  hypothetical protein  62.62 
 
 
234 aa  139  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12044  normal  0.728099 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1058  secreted protein  64.58 
 
 
222 aa  137  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  63.54 
 
 
467 aa  135  7.000000000000001e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1108  secreted protein  65.88 
 
 
249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673258  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0458  secreted protein  61.46 
 
 
216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466992  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  58.25 
 
 
209 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  53.77 
 
 
359 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0104  secreted protein  60.44 
 
 
239 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6520  hypothetical protein  65.43 
 
 
164 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  62.22 
 
 
412 aa  125  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  61.54 
 
 
389 aa  124  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1077  hypothetical protein  54.1 
 
 
272 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2200  hypothetical protein  61.11 
 
 
145 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130764  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3832  hypothetical protein  40 
 
 
263 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2063  membrane-bound transglycosylase  58.82 
 
 
445 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000226542 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0730  hypothetical protein  57.5 
 
 
348 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0832  Transglycosylase domain protein  51.69 
 
 
280 aa  104  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000463416 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  51.11 
 
 
448 aa  103  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  57.14 
 
 
231 aa  99  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0653  hypothetical protein  52.94 
 
 
258 aa  97.8  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1880  secreted protein  59.15 
 
 
196 aa  96.7  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0802  hypothetical protein  51.76 
 
 
243 aa  91.7  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  50.59 
 
 
479 aa  90.9  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2155  hypothetical protein  51.76 
 
 
282 aa  85.5  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.36389  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  53.42 
 
 
460 aa  84  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0989  hypothetical protein  42.7 
 
 
331 aa  77  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0139  hypothetical protein  48.15 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0355  G5 domain protein  45.33 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  37.14 
 
 
1995 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>