35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_07320 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  832    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  75.51 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  63.06 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  38.46 
 
 		 451 aa  163  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1108  secreted protein  68.37 
 
 		 249 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673258  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  63.96 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  73.26 
 
 		 391 aa  159  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0458  secreted protein  65.69 
 
 		 216 aa  159  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466992  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  68.04 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1058  secreted protein  54.89 
 
 		 222 aa  153  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0104  secreted protein  62.63 
 
 		 239 aa  150  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  59.62 
 
 		 209 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8519  hypothetical protein  63.37 
 
 		 234 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12044  normal  0.728099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6520  hypothetical protein  65.56 
 
 		 164 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1077  hypothetical protein  62.5 
 
 		 272 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0815  hypothetical protein  49.35 
 
 		 225 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3088  hypothetical protein  63.11 
 
 		 238 aa  140  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.696297 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2063  membrane-bound transglycosylase  64.04 
 
 		 445 aa  137  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000226542 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0733  hypothetical protein  55.96 
 
 		 220 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  60.82 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2200  hypothetical protein  70 
 
 		 145 aa  128  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130764  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0730  hypothetical protein  54.55 
 
 		 348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0734  hypothetical protein  59.14 
 
 		 227 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  59.18 
 
 		 231 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1880  secreted protein  61.8 
 
 		 196 aa  121  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0832  Transglycosylase domain protein  58.54 
 
 		 280 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000463416 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3832  hypothetical protein  51.45 
 
 		 263 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  56.98 
 
 		 479 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0802  hypothetical protein  57.3 
 
 		 243 aa  114  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  57.95 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0989  hypothetical protein  45.1 
 
 		 331 aa  93.2  9e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0355  G5 domain protein  53.66 
 
 		 328 aa  89.4  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2155  hypothetical protein  51.25 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.36389  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0139  hypothetical protein  48.75 
 
 		 194 aa  68.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  37.97 
 
 		 1995 aa  50.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>