37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8519 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8519  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  476  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12044  normal  0.728099 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3088  hypothetical protein  62.91 
 
 
238 aa  257  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.225368  normal  0.696297 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1955  G5 domain protein  50 
 
 
389 aa  150  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.586767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2726  G5 domain protein  54.89 
 
 
451 aa  148  8e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0852  G5 domain protein  65.42 
 
 
398 aa  146  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0973  G5 domain protein  63.21 
 
 
359 aa  145  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.0120305 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30320  hypothetical protein  62.75 
 
 
412 aa  143  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.2094  normal  0.165468 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0458  secreted protein  65.35 
 
 
216 aa  141  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.466992  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0734  hypothetical protein  65.42 
 
 
227 aa  139  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0815  hypothetical protein  62.62 
 
 
225 aa  138  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0338425 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07320  hypothetical protein  64.58 
 
 
467 aa  138  8.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.356724 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2729  G5 domain protein  51.43 
 
 
391 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.432238  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3832  hypothetical protein  50.34 
 
 
263 aa  135  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0105  secreted protein  61.68 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0104  secreted protein  40.71 
 
 
239 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1058  secreted protein  70.73 
 
 
222 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0869  hypothetical protein  58.88 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.494437  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1108  secreted protein  61.46 
 
 
249 aa  128  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673258  normal  0.378416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0733  hypothetical protein  60 
 
 
220 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1077  hypothetical protein  65.26 
 
 
272 aa  126  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6520  hypothetical protein  50.45 
 
 
164 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166235 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2063  membrane-bound transglycosylase  59.41 
 
 
445 aa  122  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000226542 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1954  protein of unknown function DUF348  51.96 
 
 
448 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.438312 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2200  hypothetical protein  56 
 
 
145 aa  113  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.130764  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0653  hypothetical protein  59.55 
 
 
258 aa  108  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0802  hypothetical protein  54.46 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1880  secreted protein  50.54 
 
 
196 aa  102  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.953816 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0730  hypothetical protein  55 
 
 
348 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.122999 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1453  hypothetical protein  55.81 
 
 
479 aa  101  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2155  hypothetical protein  60.71 
 
 
282 aa  99  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.36389  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0347  hypothetical protein  51.46 
 
 
231 aa  98.2  9e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00419342  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0063  G5 domain protein  56.47 
 
 
460 aa  97.8  1e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0663704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0832  Transglycosylase domain protein  44.55 
 
 
280 aa  94.7  9e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000463416 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0355  G5 domain protein  60.32 
 
 
328 aa  75.5  0.0000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0989  hypothetical protein  40.82 
 
 
331 aa  71.2  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0139  hypothetical protein  45.12 
 
 
194 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.241385  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1710  Transglycosylase domain protein  36.36 
 
 
1995 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>